RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRC24Q50LG9 513 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM89AQ96GI7 184 aa22.39■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMA5P28066 241 aa22.38■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1B0GUL7 405 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CTSWP56202 376 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.37■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 SIK1P57059 783 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMB2P55268 1798 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PDE8AO60658 829 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF5LO75529 589 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC27A2O14975 620 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP6V1AP38606 617 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 KCNJ4P48050 445 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 BCORQ6W2J9 1755 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RGL2O15211 777 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 AK2P54819 239 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC27A3Q5K4L6 730 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 RUFY3Q7L099 469 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ARXQ96QS3 562 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CRKLP46109 303 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 KRT32Q14532 448 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PARP10Q53GL7 1025 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 GPTP24298 496 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 TIMM10P62072 90 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF827Q17R98 1081 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2-202ENST00000435136 BRD1O95696 1058 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 SLC15A2Q16348 729 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ITGA6P23229 1130 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ANKRD1Q15327 319 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 RTL9Q8NET4 1388 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 STK32BQ9NY57 414 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 LY75O60449 1722 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 CAMTA2O94983 1202 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ITPK1Q13572 414 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 AKT1S1Q96B36 256 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 XAGE2Q96GT9 111 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 GREM2Q9H772 168 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 GOLIM4O00461 696 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 PKP1Q13835 747 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2-202ENST00000435136 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms