RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 POLLQ9UGP5 575 aa20.56■□□□□ 0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 COL4A1P02462 1669 aa20.55■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GRM8O00222 908 aa20.55■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGA6P23229 1130 aa20.55■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.55■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.55■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.54■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP2B4P23634 1241 aa20.54■□□□□ 0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCNN1DP51172 638 aa20.54■□□□□ 0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIER1Q8N108 512 aa20.54■□□□□ 0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.52■□□□□ 0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANKRD2Q9GZV1 360 aa20.51■□□□□ 0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNJ4P48050 445 aa20.5■□□□□ 0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 LMBR1LQ6UX01 489 aa20.49■□□□□ 0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 FOXO4P98177 505 aa20.48■□□□□ 0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 LEMD3Q9Y2U8 911 aa20.47■□□□□ 0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF804BA4D1E1 1349 aa20.45■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EPHA10Q5JZY3 1008 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FBXW7Q969H0 707 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SUCLG2Q96I99 432 aa20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COA1Q9GZY4 146 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KIF16BQ96L93 1317 aa20.42■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP17L3A6NCW0 530 aa20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP17L4A6NCW7 530 aa20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UTYO14607 1347 aa20.41■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLIN1O60240 522 aa20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAF5LO75529 589 aa20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RARSP54136 660 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.39■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SHTN1A0MZ66 631 aa20.38■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.38■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.37■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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