RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428075.5

TRIOBP-209, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene TRIOBP, Length 931 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-209ENST00000428075 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 RTL9Q8NET4 1388 aa35.76■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 EYA3Q99504 573 aa35.76■■■■□ 3.32
TRIOBP-209ENST00000428075 TRAF5O00463 557 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 ECE2O60344 883 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 GCKRQ14397 625 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPM4Q8TD43 1214 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 GREM2Q9H772 168 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 PGAP2Q9UHJ9 254 aa35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP35.75■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 UFL1O94874 794 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 VEGFBP49765 207 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 CASP7P55210 303 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 CACNA1FO60840 1977 aa35.74■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 DNAAF4Q8WXU2 420 aa35.73■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 GGA1Q9UJY5 639 aa35.73■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 SCN9AQ15858 1988 aa35.73■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 RASSF10A6NK89 507 aa35.72■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 CST9Q5W186 159 aa35.72■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 MYH3P11055 1940 aa35.71■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 MICALL2Q8IY33 904 aa35.71■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 DPF2Q92785 391 aa35.71■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF521Q96K83 1311 aa35.7■■■■□ 3.31
TRIOBP-209ENST00000428075 LINS1Q8NG48 757 aa35.69■■■■□ 3.3
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TRIOBP-209ENST00000428075 PLA2G12BQ9BX93 195 aa35.69■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 XDHP47989 1333 aa35.68■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 F6X3S4 739 aa35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 EGFRP00533 1210 aa35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MYH16Q9H6N6 1097 aa35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 MINPP1Q9UNW1 487 aa35.67■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 H7C1D1 291 aa35.66■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 DEFB115Q30KQ5 88 aa35.66■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SAMD7Q7Z3H4 446 aa35.66■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 TRPM7Q96QT4 1865 aa35.65■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 VIL1P09327 827 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 SPEF2Q9C093 1822 aa35.64■■■■□ 3.3
TRIOBP-209ENST00000428075 CSF1RP07333 972 aa35.63■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 ATP2B4P23634 1241 aa35.63■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 RPS12P25398 132 aaKnown RBP35.63■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 BEND3Q5T5X7 828 aa35.63■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 FAM161AQ3B820 660 aa35.61■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 ITGA6P23229 1130 aa35.59■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 DLK2Q6UY11 383 aa35.59■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXN1O15353 648 aa35.58■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 TLL2Q9Y6L7 1015 aa35.58■■■■□ 3.29
TRIOBP-209ENST00000428075 PSME4Q14997 1843 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 G3V3G9 751 aa35.56■■■■□ 3.28
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TRIOBP-209ENST00000428075 CCT4P50991 539 aaKnown RBP35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 FOXO4P98177 505 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 DCAF8Q5TAQ9 597 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CDC37L1Q7L3B6 337 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 GMLQ99445 158 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF609O15014 1411 aa35.56■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 MED23Q9ULK4 1368 aa35.55■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP35.55■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 USP48Q86UV5 1035 aa35.55■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 WBP1LQ9NX94 342 aa35.55■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP35.54■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 TXNRD3Q86VQ6 643 aa35.54■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 PODNQ7Z5L7 613 aa35.53■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CAPNS2Q96L46 248 aa35.53■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 EPHA10Q5JZY3 1008 aa35.52■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 CYP4F22Q6NT55 531 aa35.52■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 SAPCD2Q86UD0 394 aa35.52■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP35.51■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa35.51■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 AGBL3Q8NEM8 1001 aa35.51■■■■□ 3.28
TRIOBP-209ENST00000428075 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP35.51■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KLRK1P26718 216 aa35.5■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 THSD7BQ9C0I4 1608 aa35.5■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 USP17L3A6NCW0 530 aa35.49■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 USP17L4A6NCW7 530 aa35.49■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 USP17L1Q7RTZ2 530 aa35.49■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF408Q9H9D4 720 aa35.49■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 LEMD3Q9Y2U8 911 aa35.49■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 MPHOSPH8Q99549 860 aa35.48■■■■□ 3.27
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TRIOBP-209ENST00000428075 CHRNDQ07001 517 aa35.47■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 KRT26Q7Z3Y9 468 aa35.47■■■■□ 3.27
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TRIOBP-209ENST00000428075 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa35.46■■■■□ 3.27
TRIOBP-209ENST00000428075 ADM5C9JUS6 153 aa35.46■■■■□ 3.27
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