RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 GBP3Q9H0R5 595 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP7AQ04656 1500 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 DESP17661 470 aa24.63■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 PRC1O43663 620 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 F13A1P00488 732 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 CCDC178Q5BJE1 867 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 SBNO1A3KN83 1393 aa24.62■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 AK2P54819 239 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 C8orf37Q96NL8 207 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 CETN2P41208 172 aa24.6■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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PTPRJ-201ENST00000418331 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 NYXQ9GZU5 481 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 SCLT1Q96NL6 688 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-201ENST00000418331 RAD50Q92878 1312 aa24.58■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF790Q6PG37 636 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 DACT1Q9NYF0 836 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 GNAT2P19087 354 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 TCERG1LQ5VWI1 586 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 FAM114A1Q8IWE2 563 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ATP10AO60312 1499 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA0754O94854 1291 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 SEC24BO95487 1268 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 USP26Q9BXU7 913 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.56■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 CHST3Q7LGC8 479 aa24.55■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ZNF804AQ7Z570 1209 aa24.55■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 RMND1Q9NWS8 449 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 N4BP3O15049 544 aa24.54■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 ANKRD62A6NC57 917 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 AFMP43652 599 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 CHMP4BP1P59074 171 aa24.54■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 TRIM47Q96LD4 638 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 ORAI2Q96SN7 254 aa24.54■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.53■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.53■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
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PTPRJ-201ENST00000418331 LUZP1Q86V48 1076 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 EXOC1Q9NV70 894 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 TMX1Q9H3N1 280 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-201ENST00000418331 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
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