RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 REC8O95072 547 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GCP02774 474 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RABEP1Q15276 862 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HLA-CQ95604 372 aa6.62□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANAPC15P60006 121 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MTX1Q13505 466 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GRIPAP1Q4V328 841 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TICAM2Q86XR7 235 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 EHBP1Q8NDI1 1231 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 WASF2Q9Y6W5 498 aa6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf167Q5SNV9 1468 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FOXO3O43524 673 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALDH1L1O75891 902 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GDF11O95390 407 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCM2P49736 904 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RASSF7Q02833 373 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ESCO1Q5FWF5 840 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SSH3Q8TE77 659 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF2CQ99661 725 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MEIS3Q99687 375 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP26Q9BXU7 913 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRRCC1Q9C099 1032 aa6.6□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL15A1P39059 1388 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LMO7Q8WWI1 1683 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCM4P33991 863 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDE1AP54750 535 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP46P62068 366 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF6Q5VWK0 638 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBPF4Q96M43 638 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HYPKQ9NX55 129 aa6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CPDO75976 1380 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UTYO14607 1347 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERC2O15083 957 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RNMTO43148 476 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM4AO75164 1064 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SDSP20132 328 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TEFQ10587 303 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RAB3GAP1Q15042 981 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRT24Q2M2I5 525 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf141Q5JVX7 400 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GBP4Q96PP9 640 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 USP44Q9H0E7 712 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf115Q9H7X2 142 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TLL2Q9Y6L7 1015 aa6.58□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NPHP3Q7Z494 1330 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DDX58O95786 925 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUCB2P80303 420 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BEND3Q5T5X7 828 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 G2E3Q7L622 706 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRT28Q7Z3Y7 464 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ERC1Q8IUD2 1116 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAAF4Q8WXU2 420 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BTBD11A6QL63 1104 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MX1P20591 662 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 MCCP23508 829 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KSR2Q6VAB6 950 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NUTM1Q86Y26 1132 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BEGAINQ9BUH8 593 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPG7Q9UQ90 795 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LTN1O94822 1766 aa6.56□□□□□ -1.36
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KDM3BQ7LBC6 1761 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms