RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL20-202ENST00000409189 NWD1Q149M9 1564 aa9.78□□□□□ -0.84
CCL20-202ENST00000409189 TET3O43151 1660 aa9.77□□□□□ -0.84
CCL20-202ENST00000409189 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.84
CCL20-202ENST00000409189 USP17L5A8MUK1 530 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 DGKGP49619 791 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 BTBD6Q96KE9 485 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 CABP1Q9NZU7 370 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KLF15Q9UIH9 416 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 LRP5O75197 1615 aa9.77□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ATAD2Q6PL18 1390 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 DCDC2BA2VCK2 349 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 EFSO43281 561 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 TMEM132AQ24JP5 1023 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 WWC1Q8IX03 1113 aa9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 MAST1Q9Y2H9 1570 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 NEURL1BA8MQ27 555 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ADH6P28332 368 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 BAG6P46379 1132 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 TEAD4Q15561 434 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 RRAGCQ9HB90 399 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 TMEM2Q9UHN6 1383 aa9.75□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 CD33P20138 364 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 TXLNAP40222 546 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 LAMC2Q13753 1193 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 C7orf43Q8WVR3 580 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 C8orf37Q96NL8 207 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.74□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 CEP152O94986 1710 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 EML1O00423 815 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 GNB5O14775 395 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 AMPD1P23109 780 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 FLIIQ13045 1269 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 UCN2Q96RP3 112 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 EID1Q9Y6B2 187 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 PARP3Q9Y6F1 533 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 PIK3C2BO00750 1634 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 MROH1Q8NDA8 1641 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 MYOM3Q5VTT5 1437 aa9.73□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 POM121CA8CG34 1229 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 DEPDC4Q8N2C3 294 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa9.72□□□□□ -0.85
CCL20-202ENST00000409189 PIK3R2O00459 728 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 RAD21O60216 631 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 NOS2P35228 1153 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 PSME1Q06323 249 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 CHSY3Q70JA7 882 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 SLC9A9Q8IVB4 645 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 MDFIQ99750 246 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 STRN4Q9NRL3 753 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1024Q9UPX6 916 aa9.71□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 BRINP3Q76B58 766 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 TRIM50Q86XT4 487 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 MARK1Q9P0L2 795 aa9.7□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 USP17L3A6NCW0 530 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 USP17L4A6NCW7 530 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 CLDN10P78369 228 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 USP17L2Q6R6M4 530 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 USP17L1Q7RTZ2 530 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 DEFB132Q7Z7B7 95 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 TNS4Q8IZW8 715 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 GJA3Q9Y6H8 435 aa9.69□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 CCDC141Q6ZP82 1450 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 M0R2N6 131 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 GRIN2CQ14957 1233 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 BICDL1Q6ZP65 573 aa9.68□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 ATP9BO43861 1147 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 ATP1A2P50993 1020 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 TPCN2Q8NHX9 752 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 NGLY1Q96IV0 654 aa9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 PNPLA6Q8IY17 1366 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 DKK1O94907 266 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 TBCELQ5QJ74 424 aa9.66□□□□□ -0.86
CCL20-202ENST00000409189 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms