RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000394202.8

CNN3-202, Transcript of calponin 3, humanhuman

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Gene CNN3, Length 1,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-202ENST00000394202 STAP2Q9UGK3 403 aa28.61■■■□□ 2.17
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CNN3-202ENST00000394202 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
CNN3-202ENST00000394202 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CNN3-202ENST00000394202 SPEF2Q9C093 1822 aa28.59■■■□□ 2.17
CNN3-202ENST00000394202 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP28.59■■■□□ 2.17
CNN3-202ENST00000394202 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
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CNN3-202ENST00000394202 GPR108Q9NPR9 543 aa28.58■■■□□ 2.17
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CNN3-202ENST00000394202 MROH5Q6ZUA9 1318 aa28.56■■■□□ 2.16
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CNN3-202ENST00000394202 ATP2B3Q16720 1220 aa28.52■■■□□ 2.16
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CNN3-202ENST00000394202 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.52■■■□□ 2.16
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CNN3-202ENST00000394202 C8orf34Q49A92 452 aa28.51■■■□□ 2.15
CNN3-202ENST00000394202 TTC41PQ6P2S7 1318 aa28.51■■■□□ 2.15
CNN3-202ENST00000394202 XAGE2Q96GT9 111 aa28.5■■■□□ 2.15
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CNN3-202ENST00000394202 AOX1Q06278 1338 aa28.5■■■□□ 2.15
CNN3-202ENST00000394202 SDSP20132 328 aa28.5■■■□□ 2.15
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CNN3-202ENST00000394202 C2CD5Q86YS7 1000 aa28.48■■■□□ 2.15
CNN3-202ENST00000394202 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
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CNN3-202ENST00000394202 LPIN2Q92539 896 aa28.46■■■□□ 2.15
CNN3-202ENST00000394202 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.46■■■□□ 2.15
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CNN3-202ENST00000394202 BBOX1O75936 387 aa28.45■■■□□ 2.14
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CNN3-202ENST00000394202 A0A1B0GUL6 1792 aa28.42■■■□□ 2.14
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CNN3-202ENST00000394202 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
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CNN3-202ENST00000394202 PHKA1P46020 1223 aa28.4■■■□□ 2.14
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CNN3-202ENST00000394202 UBE4AQ14139 1066 aa28.4■■■□□ 2.14
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CNN3-202ENST00000394202 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.38■■■□□ 2.13
CNN3-202ENST00000394202 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa28.37■■■□□ 2.13
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CNN3-202ENST00000394202 KCNA3P22001 575 aa28.36■■■□□ 2.13
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