RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393362.8

MAPK9-204, Transcript of mitogen-activated protein kinase 9, human

TSL 5

Gene MAPK9, Length 1,344 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MAPK9-204	ENST00000393362	DOK7	Q18PE1	504 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	GGA1	Q9UJY5	639 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	UFL1	O94874	794 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		42.46	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	MYH3	P11055	1940 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	TNIP1	Q15025	636 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		42.45	■■■■■ 4.39
MAPK9-204	ENST00000393362	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		42.44	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	ITGA6	P23229	1130 aa		42.44	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	FOXO4	P98177	505 aa		42.44	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	FAM161A	Q3B820	660 aa		42.44	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	42.44	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	XDH	P47989	1333 aa		42.42	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	PASK	Q96RG2	1323 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	ECE2	O60344	883 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	ALDH1L1	O75891	902 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	42.41	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		42.41	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	GRM8	O00222	908 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		42.4	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	PSMD14	O00487	310 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		42.39	■■■■■ 4.38
MAPK9-204	ENST00000393362	ATP2B4	P23634	1241 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	CNTROB	Q8N137	903 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	KLRG1	Q96E93	195 aa		42.38	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	42.38	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	42.37	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	42.36	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	SHTN1	A0MZ66	631 aa		42.35	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		42.34	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	42.34	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		42.33	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	PTPRC	P08575	1304 aa		42.33	■■■■■ 4.37
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		42.31	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	42.31	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		42.31	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	42.3	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	DPF2	Q92785	391 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	KAZALD1	Q96I82	304 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	CREBZF	Q9NS37	354 aa		42.3	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	SPEF2	Q9C093	1822 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362		G3V3G9	751 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	42.29	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		42.29	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	42.28	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	SUCLG2	Q96I99	432 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		42.28	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	42.27	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	MICALL2	Q8IY33	904 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	UTY	O14607	1347 aa		42.27	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	JMY	Q8N9B5	988 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	SCN9A	Q15858	1988 aa		42.26	■■■■■ 4.36
MAPK9-204	ENST00000393362	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	42.25	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	42.25	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		42.25	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	CHRND	Q07001	517 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		42.24	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362		H7C1D1	291 aa		42.23	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	MED23	Q9ULK4	1368 aa		42.23	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	42.22	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	42.22	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		42.21	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	PODN	Q7Z5L7	613 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	EGFR	P00533	1210 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	KLRK1	P26718	216 aa		42.2	■■■■■ 4.35
MAPK9-204	ENST00000393362	SNAP23	O00161	211 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	TRAF5	O00463	557 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	42.19	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	USP44	Q9H0E7	712 aa		42.19	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	42.18	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	TAF5L	O75529	589 aa		42.17	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	42.17	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	42.17	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	42.16	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		42.15	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	GML	Q99445	158 aa		42.15	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	42.15	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L3	A6NCW0	530 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L4	A6NCW7	530 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		42.14	■■■■■ 4.34
MAPK9-204	ENST00000393362	COA1	Q9GZY4	146 aa		42.14	■■■■■ 4.34

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms