RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373166.7

TRAPPC3-204, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC184Q52MB2 194 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 MRS2Q9HD23 443 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.86■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ADM5C9JUS6 153 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 HOXB7P09629 217 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.85■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 APAF1O14727 1248 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 SULF1Q8IWU6 871 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 HYPKQ9NX55 129 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.83■■□□□ 1.57
TRAPPC3-204ENST00000373166 RTL9Q8NET4 1388 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 G3V3G9 751 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.82■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa24.81■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 TRPA1O75762 1119 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 RNF186Q9NXI6 227 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 GGA3Q9NZ52 723 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.8■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 TAF1P21675 1872 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.79■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 UFL1O94874 794 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 SLC10A3P09131 477 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDCA5Q96FF9 252 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 GGA1Q9UJY5 639 aa24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
TRAPPC3-204ENST00000373166 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CSRNP1Q96S65 589 aa24.76■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 GOLGA2Q08379 1002 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.75■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCARF1Q14162 830 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 FKBP1BP68106 108 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCDH10Q9P2E7 1040 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 COL4A1P02462 1669 aa24.72■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 GNAI1P63096 354 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 IFT57Q9NWB7 429 aa24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF609O15014 1411 aa24.7■■□□□ 1.55
TRAPPC3-204ENST00000373166 PDE8AO60658 829 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L8P0C7I0 530 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 SOX10P56693 466 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYD88Q99836 296 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 MBIPQ9NS73 344 aa24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 XDHP47989 1333 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PODNQ7Z5L7 613 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 GMLQ99445 158 aa24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L3A6NCW0 530 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L4A6NCW7 530 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 ZNF853P0CG23 659 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 ATP2B4P23634 1241 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 CCDC27Q2M243 656 aa24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC3-204ENST00000373166 SCN9AQ15858 1988 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 FAM9BQ8IZU0 186 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 MOB2Q70IA6 237 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 WWC1Q8IX03 1113 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 OGFOD1Q8N543 542 aa24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC3-204ENST00000373166 CHMP4AQ9BY43 222 aa24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms