RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ORC1Q13415 861 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ELOA3Q8NG57 546 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 EDARADDQ8WWZ3 215 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PMEPA1Q969W9 287 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 EREGO14944 169 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CES1P23141 567 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ADH7P40394 386 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 GPLD1P80108 840 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PCSK7Q16549 785 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ENAMQ9NRM1 1142 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PODXL2Q9NZ53 605 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC6A14Q9UN76 642 aa6.86□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF20L1A8MW92 1017 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 J3QW42 95 aa6.85□□□□□ -1.31
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RABGGTB-202ENST00000370826 MSTNO14793 375 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ALAS2P22557 587 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SIK1P57059 783 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 HYAL2Q12891 473 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CSRNP1Q96S65 589 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.85□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF4AO95239 1232 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 ERCC3P19447 782 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 XP32Q5T750 250 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 USPL1Q5W0Q7 1092 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD6Q96KE9 485 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAJC25Q9H1X3 360 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-202ENST00000370826 CPB1P15086 417 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK8P45983 427 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 COL19A1Q14993 1142 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PODNQ7Z5L7 613 aa6.83□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM35AQ86V20 835 aa6.83□□□□□ -1.32
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RABGGTB-202ENST00000370826 NCAPG2Q86XI2 1143 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-202ENST00000370826 CEP120Q8N960 986 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ADAM23O75077 832 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 GHRHP01286 108 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 SPACA7Q96KW9 195 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 WWC3Q9ULE0 1092 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 EDN3P14138 238 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ACPPP15309 386 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 AMPD1P23109 780 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS22Q8NE09 1264 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT8Q8WV74 236 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 PLD4Q96BZ4 506 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 SETDB2Q96T68 719 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 LPIN3Q9BQK8 851 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 LATS2Q9NRM7 1088 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.8□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ALBP02768 609 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 ATP11AP98196 1134 aa6.79□□□□□ -1.32
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RABGGTB-202ENST00000370826 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RBSNQ9H1K0 784 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.79□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 M0R082 166 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 NFKBIEO00221 500 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPA1O75762 1119 aa6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
RABGGTB-202ENST00000370826 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
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