RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CEP63Q96MT8 703 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NME9Q86XW9 330 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 AKR1B10O60218 316 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 C6orf50Q9HD87 102 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RIMS2Q9UQ26 1411 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SNX21Q969T3 373 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM47Q96LD4 638 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SPAG5Q96R06 1193 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 GOPCQ9HD26 462 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 STAT6P42226 847 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SAMM50Q9Y512 469 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 FERMT3Q86UX7 667 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SH2D4AQ9H788 454 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RTN1Q16799 776 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 OGFOD1Q8N543 542 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MAP3K5Q99683 1374 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC2Q92887 1545 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB43O43298 467 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TMC6Q7Z403 805 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NPATQ14207 1427 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 OPA1O60313 960 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 HSF2BPO75031 334 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SPECC1Q5M775 1068 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 USP16Q9Y5T5 823 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 N4BP3O15049 544 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 KRT86O43790 486 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 PPP2R5BQ15173 497 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MICU3Q86XE3 530 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CEP83Q9Y592 693 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 HOXB7P09629 217 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 BICD1Q96G01 975 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RFC4P35249 363 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM14Q14142 442 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 JADE2Q9NQC1 790 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 COMMD10Q9Y6G5 202 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ATP7AQ04656 1500 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TUBB2AQ13885 445 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CTAGE9A4FU28 777 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 RPL13P26373 211 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ALDH3A1P30838 453 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ZMYM3Q14202 1370 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 DISP3Q9P2K9 1392 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TACC1O75410 805 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TNNT1P13805 278 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 HOOK2Q96ED9 719 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 TBC1D2Q9BYX2 928 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ASXL2Q76L83 1435 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 HSPA4P34932 840 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 SNX16P57768 344 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CNGA4Q8IV77 575 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC82Q8N4S0 544 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-201ENST00000356100 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 SPDYE3A6NKU9 549 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 URI1O94763 535 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 ADCY5O95622 1261 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5DP30049 168 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 CLASP1Q7Z460 1538 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRT-201ENST00000356100 CTAGE15A4D2H0 777 aa6.83□□□□□ -1.32
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