RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 CASP7P55210 303 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 TICAM2Q86XR7 235 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 ANO6Q4KMQ2 910 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 NUP188Q5SRE5 1749 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 H3BQV1 296 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 IFFO2Q5TF58 517 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 BICD2Q8TD16 824 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CFAP45Q9UL16 551 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 SPEF2Q9C093 1822 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 TJP1Q07157 1748 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 LUZP1Q86V48 1076 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 SPC24Q8NBT2 197 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 C19orf44Q9H6X5 657 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 CBX8Q9HC52 389 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS3-201ENST00000355530 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.52■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 PGBD1Q96JS3 809 aa21.52■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 CYP27B1O15528 508 aa21.51■■□□□ 1.03
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SPNS3-201ENST00000355530 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 PYCARDQ9ULZ3 195 aa21.51■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 PFKFB2O60825 505 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 NR1I2O75469 434 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 FGD1P98174 961 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 SCRN1Q12765 414 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 DSCC1Q9BVC3 393 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 GPR108Q9NPR9 543 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 KIF3AQ9Y496 699 aa21.5■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 CHGBP05060 677 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 CABP4P57796 275 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 STOX1Q6ZVD7 989 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.49■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 FOXO4P98177 505 aa21.48■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF165P49910 485 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 AGXT2Q9BYV1 514 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF75DP51815 510 aa21.46■■□□□ 1.03
SPNS3-201ENST00000355530 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa21.46■■□□□ 1.03
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SPNS3-201ENST00000355530 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 ATL3Q6DD88 541 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 TRIM5Q9C035 493 aa21.45■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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SPNS3-201ENST00000355530 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.44■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.44■■□□□ 1.02
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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SPNS3-201ENST00000355530 CIAO1O76071 339 aa21.41■■□□□ 1.02
SPNS3-201ENST00000355530 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
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