RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 DDX19BQ9UMR2 479 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 LTBP4Q8N2S1 1624 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CPDO75976 1380 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GSTO1P78417 241 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 DCAF15Q66K64 600 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 CARMIL3Q8ND23 1372 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TOMM70O94826 608 aa5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 HEG1Q9ULI3 1381 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 CNTROBQ8N137 903 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PANK1Q8TE04 598 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TEKT1Q969V4 418 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 SEC31BQ9NQW1 1179 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 USP17L4A6NCW7 530 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GRAPQ13588 217 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 USP17L1Q7RTZ2 530 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TSPYL6Q8N831 410 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC6Q8TAG9 804 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 SSH1Q8WYL5 1049 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.35□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 KDM4AO75164 1064 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 XDHP47989 1333 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 RAB3GAP1Q15042 981 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRC-201ENST00000348564 TEX11Q8IYF3 940 aa5.34□□□□□ -1.55
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PTPRC-201ENST00000348564 EIF5P55010 431 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 PDE3AQ14432 1141 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NLRP10Q86W26 655 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 RUFY2Q8WXA3 655 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TSKSQ9UJT2 592 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 NOD1Q9Y239 953 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 ECE2O60344 883 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 VAMP4O75379 141 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRC-201ENST00000348564 GYG1P46976 350 aa5.33□□□□□ -1.56
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