RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 BRF1Q92994 677 aa26.64■■□□□ 1.86
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PFKFB2O60825 505 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PGBD1Q96JS3 809 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.63■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 SPEF2Q9C093 1822 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 H7C1W4 665 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 DCCP43146 1447 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 TJP1Q07157 1748 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CAVIN2O95810 425 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PLCB2Q00722 1185 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CAMK4Q16566 473 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CBX8Q9HC52 389 aa26.62■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 LAMA4Q16363 1823 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 FOXO4P98177 505 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CFAP45Q9UL16 551 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 MYH15Q9Y2K3 1946 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 SCRN1Q12765 414 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 ATG9AQ7Z3C6 839 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 LUZP1Q86V48 1076 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CKAP2LQ8IYA6 745 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PYCARDQ9ULZ3 195 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.59■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 NR1I2O75469 434 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CHGBP05060 677 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CPDO75976 1380 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 H3BQV1 296 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 CABP4P57796 275 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 IFFO2Q5TF58 517 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 BICD2Q8TD16 824 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXD1-201ENST00000331462 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.58■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PLA2G4DQ86XP0 818 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PAG1Q9NWQ8 432 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ATL3Q6DD88 541 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 KIF3AQ9Y496 699 aa26.57■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.56■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 SPC24Q8NBT2 197 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF26B4DH59 902 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF14Q5TI25 921 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF15Q8N660 670 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 RCOR1Q9UKL0 485 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PAPPAQ13219 1627 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF75DP51815 510 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 FBXL16Q8N461 479 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ATG3Q9NT62 314 aa26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CTDNEP1O95476 244 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CHMP4CQ96CF2 233 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 GOLIM4O00461 696 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CTAGE5O15320 804 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CIAO1O76071 339 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 DDX11Q96FC9 970 aa26.53■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PTGS1P23219 599 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 CDC25BP30305 580 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF165P49910 485 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 FGD1P98174 961 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXD1-201ENST00000331462 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 EYA2O00167 538 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 LRRC2Q9BYS8 371 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 MAST3O60307 1309 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 ATF3P18847 181 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 SARM1Q6SZW1 724 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC191Q8NCU4 936 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 E7EWF7 191 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXD1-201ENST00000331462 EVCP57679 992 aa26.49■■□□□ 1.83
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