RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP19.42■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 STRN4Q9NRL3 753 aa19.42■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 PTMAP06454 111 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 FUCA2Q9BTY2 467 aa19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 PAG1Q9NWQ8 432 aa19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP19.41■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 KRT85P78386 507 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 KRT32Q14532 448 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 TJP1Q07157 1748 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 NUP188Q5SRE5 1749 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 PDCP20941 246 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 FAM184AQ8NB25 1140 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 KCPQ6ZWJ8 1503 aa19.4■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 GTF3C6Q969F1 213 aa19.39■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 DDX11Q96FC9 970 aa19.39■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.7
SHQ1-201ENST00000325599 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP19.39■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 LIG1P18858 919 aa19.39■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 BRF1Q92994 677 aa19.39■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 UBR2Q8IWV8 1755 aa19.39■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 EYA2O00167 538 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 IL2RBP14784 551 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 IL15P40933 162 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 UVSSAQ2YD98 709 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 RFX7Q2KHR2 1363 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GUL7 405 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ADCY5O95622 1261 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 CAMK4Q16566 473 aa19.38■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.37■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 LAMA4Q16363 1823 aa19.37■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.37■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 PLCB2Q00722 1185 aa19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SCRN1Q12765 414 aa19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 PPFIA3O75145 1194 aa19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 PALLDQ8WX93 1383 aa19.36■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 AP5Z1O43299 807 aa19.35■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 FOSBP53539 338 aa19.35■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.35■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA32Q96LK8 384 aa19.35■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 GPR108Q9NPR9 543 aa19.35■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 CHST3Q7LGC8 479 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 CARD10Q9BWT7 1032 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 HELLSQ9NRZ9 838 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 MCM5P33992 734 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 APOBRQ0VD83 1088 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 MAST3O60307 1309 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ELP1O95163 1332 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 KDM4AO75164 1064 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ADORA1P30542 326 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 EVA1CP58658 441 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 TTLL5Q6EMB2 1281 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 FAM89AQ96GI7 184 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SLAIN2Q9P270 581 aa19.34■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SHANK3Q9BYB0 1731 aa19.33■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SYNE4Q8N205 404 aa19.33■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 DACT1Q9NYF0 836 aa19.33■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 ASAP1Q9ULH1 1129 aa19.33■□□□□ 0.69
SHQ1-201ENST00000325599 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP19.33■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 M0R2C6 588 aa19.33■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.33■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.33■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 KAT6BQ8WYB5 2073 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 CCT2P78371 535 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 RESTQ13127 1097 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 TCIRG1Q13488 830 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 CCDC57Q2TAC2 916 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 PGBD1Q96JS3 809 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 DSCC1Q9BVC3 393 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 NUP62CLQ9H1M0 184 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 PAPPAQ13219 1627 aa19.32■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa19.31■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 E7EWF7 191 aa19.31■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 H3BQV1 296 aa19.31■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 CTDNEP1O95476 244 aa19.31■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 IFFO2Q5TF58 517 aa19.31■□□□□ 0.68
SHQ1-201ENST00000325599 OSBP2Q969R2 916 aa19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms