RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317118.12

PDE4D-202, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-202ENST00000317118 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 SASH1O94885 1247 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 POLD1P28340 1107 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 TMC4Q7Z404 712 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.27□□□□□ -1.24
PDE4D-202ENST00000317118 NPR1P16066 1061 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 GRAPQ13588 217 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 KLHDC4Q8TBB5 520 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SEC31BQ9NQW1 1179 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PITPNM1O00562 1244 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 BBOX1O75936 387 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SRGNP10124 158 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ALDH1B1P30837 517 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 STYK1Q6J9G0 422 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC24Q50LG9 513 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 MASTLQ96GX5 879 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ZBTB7AO95365 584 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PTGER2P43116 358 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 TGFB2P61812 414 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CCDC24Q8N4L8 307 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SIL1Q9H173 461 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 STAP2Q9UGK3 403 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 AOX1Q06278 1338 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 H0YIN7 160 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PDE8BO95263 885 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PDE4AP27815 886 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 TFCP2Q12800 502 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LNPKQ9C0E8 428 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ANKRD2Q9GZV1 360 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 COL4A1P02462 1669 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 TNNI3KQ59H18 835 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 C2CD5Q86YS7 1000 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CD2APQ9Y5K6 639 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF609O15014 1411 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SOCS7O14512 581 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 FGFR2P21802 821 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 FGD1P98174 961 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 METTL24Q5JXM2 366 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SP8Q8IXZ3 490 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CNKSR1Q969H4 720 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 SPON1Q9HCB6 807 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 CHRNDQ07001 517 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 GRIPAP1Q4V328 841 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LPIN2Q92539 896 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 A0A1B0GUL6 1792 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 APBB1O00213 710 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 UBE4AQ14139 1066 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4D-202ENST00000317118 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.23□□□□□ -1.25
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