RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 GOLIM4O00461 696 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 Q6ZUG5 572 aa23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TIMM10P62072 90 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TCIRG1Q13488 830 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CHMP4CQ96CF2 233 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 FUCA2Q9BTY2 467 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 PTMAP06454 111 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 EVA1CP58658 441 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.16■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 HSPA2P54652 639 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 STK3Q13188 491 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TTC6Q86TZ1 520 aa23.15■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1B0GUL7 405 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TPM2P07951 284 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 TERF1P54274 439 aa23.14■■□□□ 1.3
SPNS1-201ENST00000311008 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 FGD1P98174 961 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC24Q50LG9 513 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 KIF3AQ9Y496 699 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.14■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 FERMT3Q86UX7 667 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 PFKFB2O60825 505 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC192P0DO97 292 aa23.13■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC158Q5M9N0 1113 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 GIMAP6Q6P9H5 292 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA32Q96LK8 384 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ABCA3Q99758 1704 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 AGXT2Q9BYV1 514 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 STRN4Q9NRL3 753 aa23.12■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 BRF1Q92994 677 aa23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 DTNBO60941 627 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 KDM4AO75164 1064 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CHGBP05060 677 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ABCC12Q96J65 1359 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 H3BQV1 296 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 STARD3NLO95772 234 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 IFFO2Q5TF58 517 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 STOX1Q6ZVD7 989 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K11Q16584 847 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 USP25Q9UHP3 1055 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CFAP45Q9UL16 551 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 MAST3O60307 1309 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 JAK2O60674 1132 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 GORABQ5T7V8 394 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.09■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 ADCY5O95622 1261 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 SCRN1Q12765 414 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 RESTQ13127 1097 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 TTC39AQ5SRH9 613 aa23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
SPNS1-201ENST00000311008 CSF1RP07333 972 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 FBXL16Q8N461 479 aa23.08■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 E7EWF7 191 aa23.07■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.06■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 ATL3Q6DD88 541 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 XAGE2Q96GT9 111 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 LIG1P18858 919 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.05■■□□□ 1.28
SPNS1-201ENST00000311008 TNMDQ9H2S6 317 aa23.05■■□□□ 1.28
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