RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SPG7Q9UQ90 795 aa25.74■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 UBE2HP62256 183 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SLC52A2Q9HAB3 445 aa25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.73■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 HMMRO75330 724 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 IQUBQ8NA54 791 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 FBXO41Q8TF61 875 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 SMARCE1Q969G3 411 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 DRC1Q96MC2 740 aa25.72■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 NWD2Q9ULI1 1742 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ADCY9O60503 1353 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 AFF2P51816 1311 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 EGFL6Q8IUX8 553 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 DEF6Q9H4E7 631 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 CCDC91Q7Z6B0 441 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
PITX1-201ENST00000265340 CLCN6P51797 869 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 DNAAF4Q8WXU2 420 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 UBXN6Q9BZV1 441 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.7■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 GSCP56915 257 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 BEND3Q5T5X7 828 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 ZNF790Q6PG37 636 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 MAGEA9P43362 315 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 ATP8B2P98198 1209 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 TTC22Q5TAA0 569 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 ST5P78524 1137 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PTPN14Q15678 1187 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 FAM200AQ8TCP9 573 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 CXorf56Q9H5V9 222 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.68■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 MNS1Q8NEH6 495 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 ATP8B1O43520 1251 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 CCDC192P0DO97 292 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PACS2Q86VP3 889 aa25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 CASC1Q6TDU7 716 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 MED4Q9NPJ6 270 aa25.66■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PDIA6Q15084 440 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 C5P01031 1676 aa25.65■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 VPS72Q15906 364 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 DRC7Q8IY82 874 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 DCAF5Q96JK2 942 aa25.64■■□□□ 1.7
PITX1-201ENST00000265340 PLA2G4DQ86XP0 818 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 AK7Q96M32 723 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 ELP1O95163 1332 aa25.64■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 DISP2A7MBM2 1401 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 NEK4P51957 841 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.63■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 A0A0G2JS52 829 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 NEMFO60524 1076 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 ZNF75DP51815 510 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 L2HGDHQ9H9P8 463 aa25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 MRC1P22897 1456 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 SART3Q15020 963 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 EXOC4Q96A65 974 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.61■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 KSR2Q6VAB6 950 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 SSH3Q8TE77 659 aa25.6■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
PITX1-201ENST00000265340 EXOC5O00471 708 aa25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms