RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.64■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 CNBD1Q8NA66 436 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 RTL9Q8NET4 1388 aa24.62■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 COL4A1P02462 1669 aa24.61■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 TFCP2Q12800 502 aa24.61■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 FBXO3Q9UK99 471 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.59■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 PDE1AP54750 535 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
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UBE2B-201ENST00000265339 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 OFD1O75665 1012 aa24.58■■□□□ 1.52
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UBE2B-201ENST00000265339 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TAF1P21675 1872 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 MMP10P09238 476 aa24.56■■□□□ 1.52
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UBE2B-201ENST00000265339 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.56■■□□□ 1.52
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UBE2B-201ENST00000265339 STAP2Q9UGK3 403 aa24.56■■□□□ 1.52
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UBE2B-201ENST00000265339 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.52■■□□□ 1.52
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UBE2B-201ENST00000265339 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 GPR108Q9NPR9 543 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 MAP7D2Q96T17 732 aa24.51■■□□□ 1.51
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UBE2B-201ENST00000265339 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.5■■□□□ 1.51
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UBE2B-201ENST00000265339 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.48■■□□□ 1.51
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UBE2B-201ENST00000265339 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 GPATCH3Q96I76 525 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 SDSP20132 328 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 PDE8BO95263 885 aa24.45■■□□□ 1.51
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