RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa24.64■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 LRRC24Q50LG9 513 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 CNBD1Q8NA66 436 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 EYA2O00167 538 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 TAF7LQ5H9L4 462 aa24.63■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 RTL9Q8NET4 1388 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 NPHP1O15259 732 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 SERPINB2P05120 415 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 CIAO1O76071 339 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.62■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 COL4A1P02462 1669 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 TFCP2Q12800 502 aa24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 HSCBQ8IWL3 235 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 SPEF2Q9C093 1822 aa24.6■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 IL15P40933 162 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 MSL1Q68DK7 614 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 FBXO3Q9UK99 471 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 NRXN2Q9P2S2 1712 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 MX1P20591 662 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 PDE1AP54750 535 aa24.59■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 TSHZ3Q63HK5 1081 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 NLRP3Q96P20 1036 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 FAM13BQ9NYF5 915 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.58■■□□□ 1.53
UBE2B-201ENST00000265339 OFD1O75665 1012 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 AACSQ86V21 672 aa24.58■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP24.58■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TAF1P21675 1872 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZSCAN30Q86W11 494 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 OSBPL3Q9H4L5 887 aa24.57■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 MMP10P09238 476 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 ST5P78524 1137 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TTC22Q5TAA0 569 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 STAP2Q9UGK3 403 aa24.56■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 MSNP26038 577 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TNNI3KQ59H18 835 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 BMP2KLQ5H9B9 411 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 CNNM1Q9NRU3 951 aa24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF609O15014 1411 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.53■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 CEP126Q9P2H0 1117 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 AOX1Q06278 1338 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 GBP4Q96PP9 640 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 MPHOSPH8Q99549 860 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 PARP3Q9Y6F1 533 aa24.52■■□□□ 1.52
UBE2B-201ENST00000265339 NASPP49321 788 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 METTL24Q5JXM2 366 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 GPR108Q9NPR9 543 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 MAP7D2Q96T17 732 aa24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 PI4K2BQ8TCG2 481 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.5■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 ARID3AQ99856 593 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 TTC41PQ6P2S7 1318 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 CRY2Q49AN0 593 aa24.49■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GUL6 1792 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GUL7 405 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 DDIT3P35638 169 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 TERF1P54274 439 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 TIMM10P62072 90 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 GPATCH3Q96I76 525 aa24.48■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 SDSP20132 328 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 NEUROD6Q96NK8 337 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 AKAP2Q9Y2D5 859 aa24.46■■□□□ 1.51
UBE2B-201ENST00000265339 PDE8BO95263 885 aa24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms