RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 USTQ9Y2C2 406 aa6.06□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 AAMPQ13685 434 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 NACC1Q96RE7 527 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 MTMR7Q9Y216 660 aa6.05□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 FURINP09958 794 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 PCSK2P16519 638 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 GATA4P43694 442 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 C8orf34Q49A92 452 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ELP3Q9H9T3 547 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 TMEM63CQ9P1W3 806 aa6.04□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 A6NHS1 94 aa6.03□□□□□ -1.44
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GPBP1-201ENST00000264779 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 SELPP16109 830 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 DOC2BQ14184 412 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
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GPBP1-201ENST00000264779 TTC9Q92623 222 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 SPACA7Q96KW9 195 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ATP11AP98196 1134 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 HYAL2Q12891 473 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 USP21Q9UK80 565 aa6.03□□□□□ -1.44
GPBP1-201ENST00000264779 ADAM23O75077 832 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.02□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 RETREG2Q8NC44 543 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 GGNBP2Q9H3C7 697 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 POLIQ9UNA4 740 aa6.02□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 C9orf172C9J069 976 aa6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 FAM13AO94988 1023 aa6.01□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 ILDR2Q71H61 639 aa6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 SERPINB4P48594 390 aa6.01□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 MBTPS1Q14703 1052 aa6.01□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 CEP135Q66GS9 1140 aa6.01□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 NPR3P17342 541 aa6□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 TPSG1Q9NRR2 321 aa6□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 H3BRB1 525 aa5.99□□□□□ -1.45
GPBP1-201ENST00000264779 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.455e-8■■■□□ 15.6
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GPBP1-201ENST00000264779 CES1P23141 567 aa5.99□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 TXNRD3Q86VQ6 643 aa5.98□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 CEP120Q8N960 986 aa5.98□□□□□ -1.45
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GPBP1-201ENST00000264779 LINC01387J3KSC0 135 aa5.96□□□□□ -1.46
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GPBP1-201ENST00000264779 ICMTO60725 284 aa5.96□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 PHACTR2O75167 634 aa5.96□□□□□ -1.46
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GPBP1-201ENST00000264779 CHRDQ9H2X0 955 aa5.96□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.96□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 EREGO14944 169 aa5.95□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 TRPA1O75762 1119 aa5.95□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 CDC27P30260 824 aa5.95□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 EHHADHQ08426 723 aa5.95□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GPBP1-201ENST00000264779 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa5.95□□□□□ -1.46
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