RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 KRT85P78386 507 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 CHMP4CQ96CF2 233 aa10.28□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.76
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GUL7 405 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 GORABQ5T7V8 394 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 FAM184AQ8NB25 1140 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TNMDQ9H2S6 317 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PAG1Q9NWQ8 432 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MRVI1Q9Y6F6 885 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CACNA1FO60840 1977 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MED23Q9ULK4 1368 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CTDNEP1O95476 244 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PSMA5P28066 241 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TYRO3Q06418 890 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 RNF20Q5VTR2 975 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 SMIM5Q71RC9 77 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 OSBP2Q969R2 916 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 DCAF5Q96JK2 942 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 NUP62CLQ9H1M0 184 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 COPRSQ9NQ92 184 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 C5P01031 1676 aa10.27□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PHF14O94880 888 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ATP5JP18859 108 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 KIAA2012Q0VF49 1180 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 AIFM3Q96NN9 605 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 UTYO14607 1347 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CASP7P55210 303 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 UTRNP46939 3433 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CBX8Q9HC52 389 aa10.26□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 BIN1O00499 593 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 HLFQ16534 295 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 GTF3C6Q969F1 213 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MYL10Q9BUA6 226 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TM6SF1Q9BZW5 370 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PTPDC1A2A3K4 754 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZAP70P43403 619 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MAP3K11Q16584 847 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCDC186Q7Z3E2 898 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCDC82Q8N4S0 544 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TMEM87AQ8NBN3 555 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 IL17RAQ96F46 866 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 USP28Q96RU2 1077 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 HAUS7Q99871 368 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 SENP2Q9HC62 589 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 MAST3O60307 1309 aa10.25□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PLBD2Q8NHP8 589 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 KCNB2Q92953 911 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TRIM5Q9C035 493 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 E7EWF7 191 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 EVA1CP58658 441 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCDC192P0DO97 292 aa10.24□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GVL5 298 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 SMIM22K7EJ46 135 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 KCNQ4P56696 695 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 LMO7Q8WWI1 1683 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 APPP05067 770 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 RESTQ13127 1097 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCDC144BQ3MJ40 725 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZNF592Q92610 1267 aa10.23□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ME1P48163 572 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 XAGE2Q96GT9 111 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 HIP1O00291 1037 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 FOXP2O15409 715 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 ZBTB9Q96C00 473 aa10.22□□□□□ -0.77
GINS1-201ENST00000262460 PALLDQ8WX93 1383 aa10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144 ms