RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 NBPF4Q96M43 638 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 APOBRQ0VD83 1088 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ALDH1L1O75891 902 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RXRAP19793 462 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TESK2Q96S53 571 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 EXOC1Q9NV70 894 aa14.76□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DYNC1I1O14576 645 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ESR2Q92731 530 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CETN1Q12798 172 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CTNNA2P26232 953 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DHX58Q96C10 678 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PRIMPOLQ96LW4 560 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CUL7Q14999 1698 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TSPY3P0CV98 308 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TSPY8P0CW00 308 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 STAT6P42226 847 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KRT23Q9C075 422 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.75□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 KAT6BQ8WYB5 2073 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TYRO3Q06418 890 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CLCN1P35523 988 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DTNBO60941 627 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM114A1Q8IWE2 563 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 LINS1Q8NG48 757 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RFC4P35249 363 aa14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SPTLC2O15270 562 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 STX17P56962 302 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 AKAP4Q5JQC9 854 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 HOOK3Q86VS8 718 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SMC5Q8IY18 1101 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SYT1P21579 422 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SPAG5Q96R06 1193 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 MCM6Q14566 821 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PRAG1Q86YV5 1406 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 HLA-DOAP06340 250 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TFCP2Q12800 502 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CABP5Q9NP86 173 aa14.73□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CHMLP26374 656 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC91Q7Z6B0 441 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 G2E3Q7L622 706 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 RTL1A6NKG5 1358 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 POTEB2H3BUK9 544 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PICALMQ13492 652 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 EYA1Q99502 592 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa14.72□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TTC21AQ8NDW8 1320 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 TBCAO75347 108 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ATP6V1AP38606 617 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 PTPDC1A2A3K4 754 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ASIC1P78348 528 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CADPS2Q86UW7 1296 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 CCDC175P0C221 793 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 ARID5AQ03989 594 aa14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RALGPS1-201ENST00000259351 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 MYZAPP0CAP1 466 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 USP26Q9BXU7 913 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 RMND1Q9NWS8 449 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 JAG2Q9Y219 1238 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TMTC2Q8N394 836 aa14.71□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.7□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TRIM75PA6NK02 468 aa14.7□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 ATP2C2O75185 946 aa14.7□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.7□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TNRQ92752 1358 aa14.69□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 NAPAP54920 295 aa14.69□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.69□□□□□ -0.06
RALGPS1-201ENST00000259351 PLIN2Q99541 437 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140 ms