RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 AK7Q96M32 723 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 RNF20Q5VTR2 975 aa22.18■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 PTMSP20962 102 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 METTL24Q5JXM2 366 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.17■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 ATP2B3Q16720 1220 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 PARP10Q53GL7 1025 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 GORABQ5T7V8 394 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 SPEF2Q9C093 1822 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 USP21Q9UK80 565 aa22.16■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 PSMA5P28066 241 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.15■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 BRD1O95696 1058 aa22.14■■□□□ 1.14
HOXC11-201ENST00000243082 GOLGA6L22H0YM25 854 aa22.14■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 FAM177BA6PVY3 158 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 LARGE1O95461 756 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 SCARF1Q14162 830 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 NTSR2O95665 410 aa22.13■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 PDE8BO95263 885 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 MCTP1Q6DN14 999 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 LRP5O75197 1615 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ABCC12Q96J65 1359 aa22.12■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 KCNQ4P56696 695 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 RPS6KB1P23443 525 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.11■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ZAP70P43403 619 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 MAST3O60307 1309 aa22.1■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 CYP21A2P08686 494 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 KRT32Q14532 448 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ME3Q16798 604 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 BCORQ6W2J9 1755 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 PI16Q6UXB8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 OSBP2Q969R2 916 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 TPCN1Q9ULQ1 816 aa22.08■■□□□ 1.13
HOXC11-201ENST00000243082 FGFR2P21802 821 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 MCAMP43121 646 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 ST3GAL1Q11201 340 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 M0R2C6 588 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC83Q8IWF9 413 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 TCEANC2Q96MN5 208 aa22.07■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 NEK1Q96PY6 1258 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 RTL9Q8NET4 1388 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD1Q15327 319 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 FAM182BQ5T319 152 aa22.06■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.05■■□□□ 1.12
HOXC11-201ENST00000243082 LPIN2Q92539 896 aa22.05■■□□□ 1.12
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