RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PPIP5K2O43314 1243 aa28.02■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.02■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SYF2-201ENST00000236273 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.01■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 MPHOSPH8Q99549 860 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 NMRK2Q9NPI5 230 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 XDHP47989 1333 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 C6orf229H3BNL8 230 aa27.99■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 JDP2Q8WYK2 163 aa27.99■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 POTECB2RU33 542 aa27.98■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 DDNO94850 711 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 WASHC4Q2M389 1173 aa27.98■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 GGA1Q9UJY5 639 aa27.98■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 KIF3CO14782 793 aa27.97■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 UFL1O94874 794 aa27.97■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 CHRNDQ07001 517 aa27.97■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 RIMBP2O15034 1052 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 PLIN1O60240 522 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 ATP2B4P23634 1241 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 DPY19L2Q6NUT2 758 aa27.96■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 YDJCA8MPS7 323 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 GNAI3P08754 354 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 NIM1KQ8IY84 436 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 PANK1Q8TE04 598 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 RRAGCQ9HB90 399 aa27.95■■■□□ 2.07
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GUL6 1792 aa27.95■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.94■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ZNRF3Q9ULT6 936 aa27.94■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.94■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 WDR90Q96KV7 1748 aa27.94■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP27.93■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 EYA3Q99504 573 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.93■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 SNAP23O00161 211 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 TAF5LO75529 589 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 IRS2Q9Y4H2 1338 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 CXCL9Q07325 125 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 LRRC24Q50LG9 513 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.92■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 DOK7Q18PE1 504 aa27.91■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 KCNQ5Q9NR82 932 aa27.91■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.91■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 KLRK1P26718 216 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 EIF6P56537 245 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 MTX1Q13505 466 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 ITPRIPQ8IWB1 547 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 GPC2Q8N158 579 aa27.9■■■□□ 2.06
SYF2-201ENST00000236273 GNAI2P04899 355 aa27.89■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 MED23Q9ULK4 1368 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 SCN9AQ15858 1988 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 ECE2O60344 883 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 C20orf194Q5TEA3 1177 aa27.88■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP27.87■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 RAD17O75943 681 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 MS4A1P11836 297 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 ATG9AQ7Z3C6 839 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 GJA3Q9Y6H8 435 aa27.86■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.85■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.84■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 EYA2O00167 538 aa27.84■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 COPRSQ9NQ92 184 aa27.84■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.83■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 SCNN1DP51172 638 aa27.83■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 MVPQ14764 893 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.83■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 COG6Q9Y2V7 657 aa27.83■■■□□ 2.05
SYF2-201ENST00000236273 SCN4AP35499 1836 aa27.83■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 PSMD14O00487 310 aa27.82■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 SRGAP3O43295 1099 aa27.82■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 PDE3AQ14432 1141 aa27.82■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 UBE4AQ14139 1066 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 FBXO3Q9UK99 471 aa27.81■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 PDE8BO95263 885 aa27.8■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 KCNJ4P48050 445 aa27.8■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 PODNQ7Z5L7 613 aa27.8■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 COA1Q9GZY4 146 aa27.8■■■□□ 2.04
SYF2-201ENST00000236273 CIAO1O76071 339 aa27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms