RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225298.11

UTP18-201, Transcript of UTP18, small subunit processome component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UTP18, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP18-201ENST00000225298 IL25Q9H293 177 aa22.76■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ADRA2BP18089 450 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 NBR1Q14596 966 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SNRKQ9NRH2 765 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SCN7AQ01118 1682 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 NEK4P51957 841 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 FAM227BQ96M60 508 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.75■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 GOLIM4O00461 696 aa22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.74■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 RIC1Q4ADV7 1423 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 LAMB2P55268 1798 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ERFEQ4G0M1 354 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 RNF20Q5VTR2 975 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 LPIN2Q92539 896 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.73■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 PALD1Q9ULE6 856 aa22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 C4BP0C0L5 1744 aa22.72■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SPEF2Q9C093 1822 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 A0A0D9SFI3 127 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 NPHP1O15259 732 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 TRIM37O94972 964 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SLC5A1P13866 664 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 PHF14O94880 888 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 ADORA1P30542 326 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 NLRP3Q96P20 1036 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UTP18-201ENST00000225298 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.7■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.7■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 MAP4K1Q92918 833 aa22.7■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.7■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 PTH1RQ03431 593 aa22.69■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.69■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 MED23Q9ULK4 1368 aa22.69■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 SSFA2P28290 1259 aa22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 LRP5O75197 1615 aa22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 LRRC4BQ9NT99 713 aa22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 BRWD3Q6RI45 1802 aa22.68■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 SMIM5Q71RC9 77 aa22.67■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 NECTIN1Q15223 517 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 NFKBIBQ15653 356 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 PSMA5P28066 241 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 RXRBP28702 533 aa22.66■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 FGFR2P21802 821 aa22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 KCNB2Q92953 911 aa22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.65■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 TAF5LO75529 589 aa22.64■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.64■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
UTP18-201ENST00000225298 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.64■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 CCDC102BQ68D86 513 aa22.64■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 ZAP70P43403 619 aa22.63■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 CHRNDQ07001 517 aa22.63■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 KRT32Q14532 448 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 RASEFQ8IZ41 740 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 TXNRD1Q16881 649 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.62■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 SLC27A2O14975 620 aa22.61■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UTP18-201ENST00000225298 DDIT3P35638 169 aa22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms