RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627441.2

SPTAN1-212, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 585 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-212ENST00000627441 HPRP00739 348 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 QDPRP09417 244 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 LIPAP38571 399 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 NPY4RP50391 375 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TP53BP2Q13625 1128 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 XKR7Q5GH72 579 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 WDR88Q6ZMY6 472 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF165Q6ZSG1 346 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ABHD4Q8TB40 342 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 MEGF10Q96KG7 1140 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ZNF382Q96SR6 550 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 NABP2Q9BQ15 211 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 NAT9Q9BTE0 207 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TRIM5Q9C035 493 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 FBP2O00757 339 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 GLRA3O75311 464 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 HSD3B1P14060 373 aa6.44□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 HSD3B2P26439 372 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 HTR3AP46098 478 aa6.44□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 GUCA2AQ02747 115 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.44□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 KCNA7Q96RP8 456 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 MECRQ9BV79 373 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 NANSQ9NR45 359 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 MAPK1P28482 360 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 APLNRP35414 380 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 MYCNOSP40205 109 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 RPS5P46782 204 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 PRR20DP86480 221 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 PRR20BP86481 221 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 PRR20AP86496 221 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 C1DQ13901 141 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.43□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.43□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.43□□□□□ -1.38
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SPTAN1-212ENST00000627441 NFU1Q9UMS0 254 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 TCF19Q9Y242 345 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 CAPN7Q9Y6W3 813 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 RNF213Q63HN8 5207 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-212ENST00000627441 C5orf49A4QMS7 147 aa6.42□□□□□ -1.38
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