RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000618056.4

PMS1-220, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 1,468 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-220ENST00000618056 FXYD6P3P58550 94 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 RAB39AQ14964 217 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ADIPOQQ15848 244 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ZNF584Q8IVC4 421 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CLDN22Q8N7P3 220 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NABP1Q96AH0 204 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 Q96M85 177 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 GPA33Q99795 319 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 TMCC3Q9ULS5 477 aa21.54■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NDUFS7O75251 213 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NR4A1P22736 598 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 EFNB3Q15768 340 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 GPR139Q6DWJ6 353 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 TMEM53Q6P2H8 277 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 THSD4Q6ZMP0 1018 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 C10orf67Q8IYJ2 551 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NSMAFQ92636 917 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CLPTM1LQ96KA5 538 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 COX4I2Q96KJ9 171 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 B9A039 149 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 XKRYO14609 159 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 OR10H3O60404 316 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FPR3P25089 353 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CDAP32320 146 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 IFNGR2P38484 337 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 DAG1Q14118 895 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 CLEC12BQ2HXU8 276 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 MESTQ5EB52 335 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SMARCD3Q6STE5 483 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 DNM1P46Q6ZS02 220 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 FBXO17Q96EF6 278 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 ZNF570Q96NI8 536 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 THTPAQ9BU02 230 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 C1orf198Q9H425 327 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.52■■□□□ 1.04
PMS1-220ENST00000618056 SLC22A23A1A5C7 686 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TRIM64A6NGJ6 449 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TRIM64BA6NI03 449 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 VSTM5A8MXK1 200 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ACOT8O14734 319 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 INHBBP09529 407 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 OR4A8P0C604 315 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SDHAP31040 664 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 THBS4P35443 961 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 DNAL1Q4LDG9 190 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 FAM27BQ5VT28 67 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 C1orf94Q6P1W5 598 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 VHLLQ6RSH7 139 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RNF121Q9H920 327 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SPEF1Q9Y4P9 236 aa21.52■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PRSS37A4D1T9 235 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 H7C1Q1 480 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RASSF2P50749 326 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RAB35Q15286 201 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 BIVMQ86UB2 503 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LRRC18Q8N456 261 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LINC00471Q8N535 108 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TRIM15Q9C019 465 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 KCNN2Q9H2S1 579 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PLK3Q9H4B4 646 aa21.51■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CR1P17927 2039 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 H7C1C5 153 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GYG2O15488 501 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 TXNDC12O95881 172 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 APEHP13798 732 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GSSP48637 474 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LCN6P62502 163 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 KRT80Q6KB66 452 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 FANK1Q8TC84 345 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RASD2Q96D21 266 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LRGUKQ96M69 825 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 LRMDAQ9H2I8 198 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 IL20RAQ9UHF4 553 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 NF1P21359 2839 aa21.5■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 STAMBPO95630 424 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PTHP01270 115 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GLRXP35754 106 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RPS6KA3P51812 740 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 GALK2Q01415 458 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 SGCAQ16586 387 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 RFX4Q33E94 735 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 PGM2L1Q6PCE3 622 aa21.49■■□□□ 1.03
PMS1-220ENST00000618056 ASRGL1Q7L266 308 aa21.49■■□□□ 1.03
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