RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	BPIFA2	Q96DR5	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC19A3	Q9BZV2	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CCDC134	Q9H6E4	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CACNG2	Q9Y698	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NF1	P21359	2839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		4.87	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TEX13C	A0A0J9YWL9	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	VWC2L	B2RUY7	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498		M0R233	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SPRY3	O43610	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SYNGR3	O43761	229 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LMX1B	O60663	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MPZL1	O95297	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NPPA	P01160	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CSF3	P09919	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	IFNA8	P32881	189 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	GLRX	P35754	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	WNT5A	P41221	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CCL8	P80075	99 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PSG4	Q00888	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MVK	Q03426	396 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PLP2	Q04941	152 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MEP1B	Q16820	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC36A2	Q495M3	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SPRN	Q5BIV9	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	THEM4	Q5T1C6	240 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RINL	Q6ZS11	566 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	ABHD4	Q8TB40	342 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NABP1	Q96AH0	204 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498		Q96M85	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	RBP7	Q96R05	134 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	GPA33	Q99795	319 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	KCNS2	Q9ULS6	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	GMNC	A6NCL1	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SOCS2	O14508	198 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC22A2	O15244	555 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MGRN1	O60291	552 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SNX3	O60493	162 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	SLC16A7	O60669	478 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	LILRA1	O75019	489 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	GMNN	O75496	209 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PDE5A	O76074	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PRSS23	O95084	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	PPP1R3D	O95685	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	NGF	P01138	241 aa		4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	MMP7	P09237	267 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
HCG18-243	ENST00000602498	CTLA4	P16410	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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