RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598895.5

ZNF548-209, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ZNF548, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-209ENST00000598895 LYPD3O95274 346 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 HRGP04196 525 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 IGHV1-2P23083 117 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 GSSP48637 474 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 P2RY4P51582 365 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 TPTEP56180 551 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 TAS2R41P59536 307 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 LTBQ06643 244 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 LGALS3BPQ08380 585 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 STK11Q15831 433 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 FAM69AQ5T7M9 428 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 SLX4IPQ5VYV7 408 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 FBXW9Q5XUX1 488 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 STEAP3Q658P3 488 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF544Q6NX49 715 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 TMEM53Q6P2H8 277 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF613Q6PF04 617 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 Q6ZT83 130 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 AAED1Q7RTV5 226 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 ZIC4Q8N9L1 334 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF417Q8TAU3 575 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 SLC41A3Q96GZ6 507 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 MOGAT1Q96PD6 335 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 MGLLQ99685 303 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 GPR52Q9Y2T5 361 aa10.65□□□□□ -0.7
ZNF548-209ENST00000598895 FREM1Q5H8C1 2179 aa10.65□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 A0A1W2PPR1 153 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 A0A1W2PR80 420 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 FAM221AA4D161 298 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 DEFB108AA8MXU0 73 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 OR2T1O43869 369 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 RAD51DO75771 328 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SERPINI2O75830 405 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PTHP01270 115 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 BGLAPP02818 100 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 OSMP13725 252 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CRYGSP22914 178 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 C1DQ13901 141 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 NIPAL3Q6P499 406 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CREB3L2Q70SY1 520 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CCDC190Q86UF4 302 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 NKAIN4Q8IVV8 208 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 AQP11Q8NBQ7 271 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 HTRA1Q92743 480 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SLC30A2Q9BRI3 323 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 MND1Q9BWT6 205 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 OR51E2Q9H255 320 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SLC7A10Q9NS82 523 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 UPB1Q9UBR1 384 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 RASD1Q9Y272 281 aa10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CIB4A0PJX0 185 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CH25HO95992 272 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SCG5P05408 212 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 KRT8P05787 483 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 HSMCR30P0CW71 290 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PPP3CBP16298 524 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SLC15A1P46059 708 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SELENOPP49908 381 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 NUDT6P53370 316 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 CLDN17P56750 224 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 RUNX1T1Q06455 604 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 P2RY6Q15077 328 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 MED22Q15528 200 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TAB1Q15750 504 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 KCNJ8Q15842 424 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TSTQ16762 297 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 LINC00114Q6XXX2 140 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 OR52J3Q8NH60 311 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PFN4Q8NHR9 129 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TMEM255BQ8WV15 326 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TMEM80Q96HE8 168 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PRSS27Q9BQR3 290 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 TMEM43Q9BTV4 400 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 ASPNQ9BXN1 380 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 HDHD5Q9BXW7 423 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 SMURF1Q9HCE7 757 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 POLE4Q9NR33 117 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 PARPBPQ9NWS1 579 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 ASB6Q9NWX5 421 aa10.63□□□□□ -0.71
ZNF548-209ENST00000598895 RHCGQ9UBD6 479 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms