RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 RUNDC3AQ59EK9 446 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PRR31Q5SQ13 230 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 RETREG3Q86VR2 466 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC18Q8N456 261 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 OR4D11Q8NGI4 311 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 C22orf15Q8WYQ4 148 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CCL17Q92583 94 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2ACQ93077 130 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TLCD1Q96CP7 247 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MPP4Q96JB8 637 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 C7orf26Q96N11 449 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 EBF4Q9BQW3 602 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC28BQ9BUN5 200 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHAC1Q9H158 963 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 NTN4Q9HB63 628 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa8.74□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4EA0A075B759 164 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PRG6 482 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MCIDASD6RGH6 385 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4DF5H284 164 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRY3O43610 288 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TRMUO75648 421 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 F13BP05160 661 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ADH4P08319 380 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4FP0DN26 164 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 HKR1P10072 659 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ACADSP16219 412 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNOP22674 350 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 FPR2P25090 351 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 STOMP27105 288 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 GCH1P30793 250 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MPV17P39210 176 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT5AP41221 380 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP4BP51164 291 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 UGT2B15P54855 530 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LCN2P80188 198 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC3A1Q07837 685 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP51A1Q16850 503 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TUSC1Q2TAM9 212 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF718Q3SXZ3 478 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 AGKQ53H12 422 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 THEM4Q5T1C6 240 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 C10orf128Q5T292 105 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 HDDC2Q7Z4H3 204 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT14Q8NB59 555 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ASB10Q8WXI3 467 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF747Q9BV97 191 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNN2Q9H2S1 579 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF696Q9H7X3 374 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SIAEQ9HAT2 523 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PPIAL4AQ9Y536 164 aa8.73□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PLSCR5A0PG75 271 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ISPDA4D126 451 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXH1O75593 365 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC2A10O95528 541 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF32P17041 273 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CD247P20963 164 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 CDAP32320 146 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 LIPAP38571 399 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 DAP3P51398 398 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MTPNP58546 118 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 FOXL1Q12952 345 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SELPLGQ14242 412 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SHISA2Q6UWI4 295 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 DHDDSQ86SQ9 333 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 TREML1Q86YW5 311 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 ST7LQ8TDW4 575 aa8.72□□□□□ -1.01
EFTUD2-226ENST00000593200 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms