RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 SYS1Q8N2H4 156 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF454Q8N9F8 522 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF485Q8NCK3 441 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 TBX5Q99593 518 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 ULBP2Q9BZM5 246 aa27.48■■□□□ 1.99
CAPNS1-206ENST00000588815 CALHM2Q9HA72 323 aa27.48■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A18Q9H1K4 315 aa27.47■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 OR10H5Q8NGA6 315 aa27.45■■□□□ 1.99
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CAPNS1-206ENST00000588815 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 TDGF1P3P51864 188 aa27.44■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2A2Q6IF42 318 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 PHYHD1Q5SRE7 291 aa27.44■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 TAS2R43P59537 309 aa27.43■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB2Q16082 182 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 SEC61A2Q9H9S3 476 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa27.43■■□□□ 1.98
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CAPNS1-206ENST00000588815 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 C11orf40Q8WZ69 217 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 APH1AQ96BI3 265 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 YIPF6Q96EC8 236 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXN4Q96NZ1 517 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 TTYH2Q9BSA4 534 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM36Q9NQ86 728 aa27.42■■□□□ 1.98
CAPNS1-206ENST00000588815 POLE4Q9NR33 117 aa27.42■■□□□ 1.98
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