RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RBP7Q96R05 134 aa8.66□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 IFT27Q9BW83 186 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 EGLN3Q9H6Z9 239 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 CRLF2Q9HC73 371 aa8.66□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 KIF17Q9P2E2 1029 aa8.66□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 PPP2R2BQ00005 443 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 C3orf36Q3SXR2 165 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 FOXB1Q99853 325 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 NELFAQ9H3P2 528 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 NGBQ9NPG2 151 aa8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 USE1Q9NZ43 259 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 IL20RAQ9UHF4 553 aa8.65□□□□□ -1.02
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GGA3-209ENST00000580646 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
GGA3-209ENST00000580646 SLC22A23A1A5C7 686 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 WNT11O96014 354 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NPR2P20594 1047 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PRKACGP22612 351 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NOS3P29474 1203 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 HOXC12P31275 282 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 GRK5P34947 590 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF84P51523 738 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 NR1H2P55055 460 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-209ENST00000580646 TSC22D1Q15714 1073 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-209ENST00000580646 WDR31Q8NA23 367 aa8.64□□□□□ -1.03
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GGA3-209ENST00000580646 RASD2Q96D21 266 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 WACQ9BTA9 647 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 C9orf16Q9BUW7 83 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TSSK6Q9BXA6 273 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TEX12Q9BXU0 123 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A19Q9HC21 320 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 C8orf4Q9NR00 106 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KRT84Q9NSB2 600 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 RHBDL2Q9NX52 303 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 KLHL21Q9UJP4 597 aa8.64□□□□□ -1.03
GGA3-209ENST00000580646 SLC25A15Q9Y619 301 aa8.64□□□□□ -1.03
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