RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 E9PLD3 99 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 H0YCG3 227 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 H0YIV9 168 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 LAD1O00515 517 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PRRG1O14668 218 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 AQP9O43315 295 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CCNE2O96020 404 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CALB1P05937 261 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 UGT2B4P06133 528 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 KRT16P08779 473 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 OCM2P0CE71 109 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PRG2P13727 222 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CASP14P31944 242 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 HNMTP50135 292 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 ARPP19P56211 112 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 AP1S2P56377 157 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 GPX6P59796 221 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 VSNL1P62760 191 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 VLDLRP98155 873 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 KCNJ11Q14654 390 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PON2Q15165 354 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 KCNJ8Q15842 424 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 GSG1Q2KHT4 349 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TIGITQ495A1 244 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 MARC1Q5VT66 337 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SLC22A10Q63ZE4 541 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 UTS2BQ765I0 119 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CLEC4FQ8N1N0 589 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 OR5L2Q8NGL0 311 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 OR2T3Q8NH03 318 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 MRAPQ8TCY5 172 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 KCTD4Q8WVF5 259 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SCFD1Q8WVM8 642 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 FAM3CQ92520 227 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PSMG2Q969U7 264 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 VSIG2Q96IQ7 327 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 RIT2Q99578 217 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TXN2Q99757 166 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM175Q9BSA9 504 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TEKT3Q9BXF9 490 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 GON7Q9BXV9 100 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 GPR61Q9BZJ8 451 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 RHBGQ9H310 441 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 C6orf50Q9HD87 102 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 HEBP1Q9NRV9 189 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 DPM3Q9P2X0 92 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PSME2Q9UL46 239 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CACNA1BQ00975 2339 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TRIOO75962 3097 aa3.45□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 FAM186AA6NE01 2351 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CACNA1HO95180 2353 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 RAB19A4D1S5 217 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF98A6NK75 572 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 C2orf74A8MZ97 194 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 H0YJX3 145 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 H3BMQ9 156 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 K7EQM0 130 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 FCN1O00602 326 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PHOX2AO14813 284 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SNAP29O95721 258 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 IFNA16P05015 189 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 BMI1P35226 326 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 RCVRNP35243 200 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 HPCAL1P37235 193 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 VHLP40337 213 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP10-12P60413 245 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 RAB4BP61018 213 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 CD47Q08722 323 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 ITIH4Q14624 930 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 LAGE3Q14657 143 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TGFBIQ15582 683 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 PSMD5Q16401 504 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 GGTA1PQ4G0N0 100 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 BRMS1LQ5PSV4 323 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 THEM4Q5T1C6 240 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 TTC23Q5W5X9 447 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SPINK14Q6IE38 97 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 VITQ6UXI7 678 aa3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PRPF39-212ENST00000557477 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms