RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553920.5

RBM23-211, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-211	ENST00000553920	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		7	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ACOD1	A6NK06	481 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	FAM157A	C9JC47	383 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TRIM77	I1YAP6	450 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SNAP29	O95721	258 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CLPTM1	O96005	669 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	BCHE	P06276	602 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ADRA2A	P08913	450 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ETS2	P15036	469 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	IFNGR1	P15260	489 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	BGN	P21810	368 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	COL8A2	P25067	703 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TRIM16L	Q309B1	348 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ATG16L1	Q676U5	607 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	KRT80	Q6KB66	452 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	LRP11	Q86VZ4	500 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM123	Q8N131	208 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	STK35	Q8TDR2	534 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SLC25A36	Q96CQ1	311 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	OR2M2	Q96R28	347 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	RMND5A	Q9H871	391 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	FGFR1OP2	Q9NVK5	253 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SPATA2	Q9UM82	520 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.99	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	MS4A18	H0YCH9	400 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920		M0R082	166 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	WRB	O00258	174 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TRAF3IP2	O43734	574 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SNX3	O60493	162 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TNFAIP8	O95379	198 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	AHSA1	O95433	338 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	HPR	P00739	348 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	HLA-H	P01893	362 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	HPX	P02790	462 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF35	P13682	527 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	HLA-DOB	P13765	273 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	UQCRB	P14927	111 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CBL	P22681	906 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	NR4A1	P22736	598 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	EPHA3	P29320	983 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ARR3	P36575	388 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	COPZ1	P61923	177 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	IL1RL1	Q01638	556 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	BST1	Q10588	318 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	NPRL3	Q12980	569 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	DAG1	Q14118	895 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ERICH5	Q6P6B1	374 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	DEF8	Q6ZN54	512 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	YIPF5	Q969M3	257 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TAAR8	Q969N4	342 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM19	Q96HH6	336 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	OXGR1	Q96P68	337 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ECSIT	Q9BQ95	431 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	SPATA9	Q9BWV2	254 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	P2RX2	Q9UBL9	471 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	RCE1	Q9Y256	329 aa		6.98	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920		A0A096LPI6	279 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
RBM23-211	ENST00000553920		M0R3G1	203 aa		6.97	□□□□□ -1.29

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms