RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	IGHV1-2	P23083	117 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SELENOP	P49908	381 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FXYD6P3	P58550	94 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PRPS1	P60891	318 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MST1L	Q2TV78	715 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ALG10	Q5BKT4	473 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	WDFY1	Q8IWB7	410 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TMEM123	Q8N131	208 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AQP11	Q8NBQ7	271 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TXNDC15	Q96J42	360 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR2M2	Q96R28	347 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	INIP	Q9NRY2	104 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MED29	Q9NX70	200 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MALT1	Q9UDY8	824 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.98	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		A0A1W2PRG6	482 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		M0R1B8	84 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SERPINI2	O75830	405 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IFNGR1	P15260	489 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PDLIM4	P50479	330 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PRR31	Q5SQ13	230 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NIPAL3	Q6P499	406 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CD300LD	Q6UXZ3	194 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222		Q6ZT83	130 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SLC35D2	Q76EJ3	337 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR6X1	Q8NH79	312 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FBXO17	Q96EF6	278 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FEV	Q99581	238 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	EMC6	Q9BV81	110 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	S100A14	Q9HCY8	104 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		11.97	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	RAD51D	O75771	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NDUFB2	O95178	105 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IGHM	P01871	453 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF23	P17027	643 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	GSTM3	P21266	225 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PRKACG	P22612	351 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CD40	P25942	277 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ARHGDIA	P52565	204 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	BID	P55957	195 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	CTXN1	P60606	82 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	MELK	Q14680	651 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TAF11	Q15544	211 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TRIP10	Q15642	601 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	AWAT1	Q58HT5	328 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ASB10	Q8WXI3	467 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	LRR1	Q96L50	414 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	PKP2	Q99959	881 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	METRN	Q9UJH8	293 aa		11.96	□□□□□ -0.49
CS-231	ENST00000552222	ZNF726	A6NNF4	738 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PDLIM1	O00151	329 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	SLC43A1	O75387	559 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	UPK3A	O75631	287 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	BCL10	O95999	233 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CD14	P08571	375 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	ANXA8	P13928	327 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	LGALS3BP	Q08380	585 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	COX10	Q12887	443 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	CAMK2D	Q13557	499 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	RFX4	Q33E94	735 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	FAM122B	Q7Z309	247 aa		11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	11.95	□□□□□ -0.5
CS-231	ENST00000552222	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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