RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 FUT4P22083 530 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 AHCYP23526 432 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 ALDH3A1P30838 453 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 MVDP53602 400 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 EMX2Q04743 252 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 PUDPQ08623 228 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 MELKQ14680 651 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 SNX32Q86XE0 403 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 LYG1Q8N1E2 194 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 LRRC18Q8N456 261 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 TBC1D15Q8TC07 691 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 C10orf82Q8WW14 230 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 POM121L2Q96KW2 1035 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 PPP1R36Q96LQ0 422 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 SPATA9Q9BWV2 254 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 POFUT1Q9H488 388 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 ASIC5Q9NY37 505 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.34□□□□□ -0.59
CS-230ENST00000551968 CCDC154A6NI56 674 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 RIPK2O43353 540 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TSPAN9O75954 239 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 BCHEP06276 602 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 STOMP27105 288 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 APLNRP35414 380 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 CFHR2P36980 270 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 MMP16P51512 607 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PSG7Q13046 419 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SLC36A2Q495M3 483 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 FAM201AQ5SY85 155 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ANXA8L1Q5VT79 327 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SLC27A4Q6P1M0 643 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LYPD2Q6UXB3 125 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 VPS37AQ8NEZ2 397 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ABHD4Q8TB40 342 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TEX37Q96LM6 180 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SAMD8Q96LT4 415 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 CCDC115Q96NT0 180 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TMEM246Q9BRR3 403 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ACOXLQ9NUZ1 547 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PRDM4Q9UKN5 801 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.33□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 C5orf49A4QMS7 147 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 MGRN1O60291 552 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 QDPRP09417 244 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ETFAP13804 333 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 MMP9P14780 707 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 CCT5P48643 541 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 BPIFB3P59826 476 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PPP1CBP62140 327 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PLP2Q04941 152 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 HERPUD1Q15011 391 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 MTX3Q5HYI7 312 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PXKQ7Z7A4 578 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 C4orf33Q8N1A6 199 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SCAIQ8N9R8 606 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SLC38A5Q8WUX1 472 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TESCQ96BS2 214 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 MRPL39Q9NYK5 338 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.32□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LYSTQ99698 3801 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 FARS2O95363 451 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PTHP01270 115 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PGA4P0DJD7 388 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 PGA3P0DJD8 388 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 LIPAP38571 399 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ERFP50548 548 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 HSF2Q03933 536 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 BST1Q10588 318 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ALG10BQ5I7T1 473 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SLC35E4Q6ICL7 350 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ZNF841Q6ZN19 808 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 SLC35D2Q76EJ3 337 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 OR6X1Q8NH79 312 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TMEM19Q96HH6 336 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 ASPNQ9BXN1 380 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 TSPYL1Q9H0U9 437 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 AKTIPQ9H8T0 292 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 C12orf10Q9HB07 376 aa11.31□□□□□ -0.6
CS-230ENST00000551968 GCM1Q9NP62 436 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms