RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 CHODLQ9H9P2 273 aa14.56□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RPS6KA6Q9UK32 745 aa14.56□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 A4GNTQ9UNA3 340 aa14.56□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.083e-12■■■■□ 26
CASP9-211ENST00000546969 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa14.56□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RNF212BA8MTL3 300 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SNAP29O95721 258 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 FAM157BP0CG42 384 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SRD5A1P18405 259 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ALDH3B1P43353 468 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 YAP1P46937 504 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RUNX1T1Q06455 604 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 HACD2Q6Y1H2 254 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 NRMQ8IXM6 262 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SPATA3Q8NHX4 192 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ZNF519Q8TB69 540 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TMEM158Q8WZ71 300 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 NSMAFQ92636 917 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RDH5Q92781 318 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SEPHS2Q99611 448 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TAAR3PQ9P1P4 343 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 FZR1Q9UM11 496 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TMEM5Q9Y2B1 443 aa14.55□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 XKRYO14609 159 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ATP8B1O43520 1251 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SERPINA1P01009 418 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 CCNOP22674 350 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RPL4P36578 427 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 UCP2P55851 309 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TEKQ02763 1124 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 PCGF3Q3KNV8 242 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ARL9Q6T311 187 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 CBLL1Q75N03 491 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ZNF584Q8IVC4 421 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 C1orf174Q8IYL3 243 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 OR51A7Q8NH64 312 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 FGFBP3Q8TAT2 258 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 MDFIQ99750 246 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 RHCGQ9UBD6 479 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 GRHPRQ9UBQ7 328 aa14.54□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 PIP5K1CO60331 668 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SLC2A10O95528 541 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TACSTD2P09758 323 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TSPAN19P0C672 248 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ACHEP22303 614 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 STOMP27105 288 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 GCH1P30793 250 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 GSK3BP49841 420 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 TMEM33P57088 247 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 PRKCDQ05655 676 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 KRT72Q14CN4 511 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 LINC01356Q8N9X3 169 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 HSH2DQ96JZ2 352 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 SNX18Q96RF0 628 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 OR51B6Q9H340 312 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD19PQ9H560 264 aa14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
CASP9-211ENST00000546969 LRP5LA4QPB2 252 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 C12orf71A8MTZ7 269 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 NME4O00746 187 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 IGHMP01871 453 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 CCL2P13500 99 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 CDAP32320 146 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 ARHGDIAP52565 204 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 SEC24CP53992 1094 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 PSME3P61289 254 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 ZNF718Q3SXZ3 478 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 FAM27BQ5VT28 67 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 LRP11Q86VZ4 500 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 WACQ9BTA9 647 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 DECR2Q9NUI1 292 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 ADA2Q9NZK5 511 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.52□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 TRAV27A0A087WT01 109 aa14.51□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 A0A1W2PPL8 197 aa14.51□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 PLSCR5A0PG75 271 aa14.51□□□□□ -0.09
CASP9-211ENST00000546969 C5orf49A4QMS7 147 aa14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms