RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, human

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CLSTN3-215	ENST00000544584	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR4K5	Q8NGD3	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR51A7	Q8NH64	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PFN4	Q8NHR9	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MCHR2	Q969V1	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TXNDC15	Q96J42	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF570	Q96NI8	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	DIRC2	Q96SL1	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SMR3A	Q99954	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	REG4	Q9BYZ8	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	NELFA	Q9H3P2	528 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584		A0A1W2PPL8	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584		J3QW42	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SNAP29	O95721	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CD8A	P01732	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	IGHV4-39	P01824	125 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LCK	P06239	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CST2	P09228	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TSPAN19	P0C672	248 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TNFRSF1B	P20333	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PTN	P21246	168 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MSR1	P21757	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CCNO	P22674	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	STOM	P27105	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SDHA	P31040	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC6A6	P31641	620 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CENPA	P49450	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	GZMK	P49863	264 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	BLVRA	P53004	296 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	GLO1	Q04760	184 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PIGF	Q07326	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LGALS3BP	Q08380	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ECH1	Q13011	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TNK1	Q13470	666 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MELK	Q14680	651 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LAPTM4A	Q15012	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ADIPOQ	Q15848	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CARTPT	Q16568	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	HIST3H3	Q16695	136 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	KRT80	Q6KB66	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SMARCD3	Q6STE5	483 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LRRC18	Q8N456	261 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	GJC3	Q8NFK1	279 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	HPS1	Q92902	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	TIMD4	Q96H15	378 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CLSTN3-215	ENST00000544584	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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