RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538886.5

GGA3-202, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GGA3, Length 3,766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-202ENST00000538886 OR4K13Q8NH42 304 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RBP7Q96R05 134 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RHNO1Q9BSD3 238 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TMEM38AQ9H6F2 299 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ENPP4Q9Y6X5 453 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CACNA1DQ01668 2161 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 A8MVM7 634 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 FABP7O15540 132 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PIP5K1CO60331 668 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PRKAR1BP31321 381 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 GPR50Q13585 617 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 Q6ZS92 163 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RNF165Q6ZSG1 346 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 FCRLAQ7L513 359 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 WFDC8Q8IUA0 241 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CCDC36Q8IYA8 594 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 GDPD1Q8N9F7 314 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 OR2V1Q8NHB1 315 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MAB21L2Q9Y586 359 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MYL12BO14950 172 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ORC5O43913 435 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MYL12AP19105 171 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PAICSP22234 425 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 IGFBP5P24593 272 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TNFSF8P32971 234 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MEOX2P50222 304 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TSC22D1Q15714 1073 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LRRC18Q8N456 261 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 OR13C2Q8NGS9 318 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 NEIL3Q8TAT5 605 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ALG5Q9Y673 324 aa7.89□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MITFO75030 526 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ATG12O94817 140 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MST1P26927 711 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 S100A12P80511 92 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LINC00303Q3SY05 128 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ALG10Q5BKT4 473 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CYB5R2Q6BCY4 276 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PODNL1Q6PEZ8 512 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LINC00299Q6ZSB3 139 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KRT74Q7RTS7 529 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 GDF7Q7Z4P5 450 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TBX5Q99593 518 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 NPAS1Q99742 590 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 IL20Q9NYY1 176 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ZNF639Q9UID6 485 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CLCA1A8K7I4 914 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 M0R233 179 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 RAD51DO75771 328 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LGI1O95970 557 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KRTCAP3Q53RY4 240 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 GLCCI1Q86VQ1 547 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 IQCF1Q8N6M8 205 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 OR52N5Q8NH56 324 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LINC00052Q96N35 136 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 PFDN5Q99471 154 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 FEVQ99581 238 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TIMP4Q99727 224 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KLHDC3Q9BQ90 382 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 KCNJ16Q9NPI9 418 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 HCN1O60741 890 aa7.88□□□□□ -1.15
GGA3-202ENST00000538886 LYZL6O75951 148 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms