RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531466.1

PTPRK-220, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 311 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-220ENST00000531466 C12orf57Q99622 126 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RBBP8Q99708 897 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TIMM29Q9BSF4 260 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 NICN1Q9BSH3 213 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF426Q9BUY5 554 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TMED9Q9BVK6 235 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 TREM2Q9NZC2 230 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 COPS7AQ9UBW8 275 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 IL36AQ9UHA7 158 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OPN4Q9UHM6 478 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PHF11Q9UIL8 331 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ANAPC7Q9UJX3 599 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PPIAL4AQ9Y536 164 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CCDC144AA2RUR9 1427 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 RIMS2Q9UQ26 1411 aa2.76□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 A0A0U1RRA0 63 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 A0A1B0GVL5 298 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 NPIPA5E9PKD4 350 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 M0QZ92 97 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 DFFAO00273 331 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 PDXKO00764 312 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CYB561D2O14569 222 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 RFXANKO14593 260 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GMDSO60547 372 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ENTPD5O75356 428 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 MED6O75586 246 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 GATBO75879 557 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 VAPBO95292 243 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ETHE1O95571 254 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SERPINA1P01009 418 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 S100A8P05109 93 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 DCNP07585 359 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SFTPBP07988 381 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 SCGB1A1P11684 91 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 ETS2P15036 469 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 CYB561P49447 251 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TPMTP51580 245 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 HPCAP84074 193 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SLC9A3R2Q15599 337 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR4D1Q15615 310 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TPSAB1Q15661 275 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 POU2AF1Q16633 256 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 HAGHQ16775 308 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 SPIN3Q5JUX0 258 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 AGAP6Q5VW22 663 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRK-220ENST00000531466 MOB2Q70IA6 237 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CBWD2Q8IUF1 395 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 Q8N402 240 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 STX19Q8N4C7 294 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ZNF525Q8N782 197 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 TMEM99Q8N816 258 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 PXT1Q8NFP0 134 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR51D1Q8NGF3 324 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 OR10J5Q8NHC4 309 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 LINC01006Q8NI28 216 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 NANPQ8TBE9 248 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 ACTRT1Q8TDG2 376 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRK-220ENST00000531466 CXorf40AQ8TE69 158 aa2.75□□□□□ -1.97
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