RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525121.2

HMGB1P40-201, Transcript of high mobility group box 1 pseudogene 40, humanhuman

BASIC

Gene HMGB1P40, Length 540 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P40-201ENST00000525121 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ENOPH1Q9UHY7 261 aa4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 KLHL21Q9UJP4 597 aa4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 MOKQ9UQ07 419 aa4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 AP4S1Q9Y587 144 aa4.71□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SHISA9B4DS77 424 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 G3V2T6 193 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 TIPRLO75663 272 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SOX14O95416 240 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 TXNDC12O95881 172 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PLAUP00749 431 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 GASTP01350 101 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 IGLV1-44P01699 117 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 HLA-DQA2P01906 255 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SERPINA5P05154 406 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CST2P09228 141 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF23P17027 643 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CD53P19397 219 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PAICSP22234 425 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 POU1F1P28069 291 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 LOXP28300 417 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 LAP3P28838 519 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CDAP32320 146 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 GDI2P50395 445 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 IST1P53990 364 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SELENOVP59797 346 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 GLO1Q04760 184 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SPOCK1Q08629 439 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SCRN3Q0VDG4 424 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 AQP6Q13520 282 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FHL1Q13642 323 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 DAG1Q14118 895 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 RAB39AQ14964 217 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ATP6AP1Q15904 470 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC36A3Q495N2 470 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FAM27BQ5VT28 67 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC27A4Q6P1M0 643 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 VHLLQ6RSH7 139 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ARL9Q6T311 187 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 THSD4Q6ZMP0 1018 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ASRGL1Q7L266 308 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FAM122BQ7Z309 247 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SKA3Q8IX90 412 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 MUC15Q8N387 334 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SVOPLQ8N434 492 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SLC30A7Q8NEW0 376 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PROKR2Q8NFJ6 384 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR52E2Q8NGJ4 325 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR2T4Q8NH00 348 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR4K13Q8NH42 304 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 NRBF2Q96F24 287 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PLEKHA8Q96JA3 519 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FEVQ99581 238 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 GPA33Q99795 319 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 FOXC2Q99958 501 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 TSSK6Q9BXA6 273 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 LIME1Q9H400 295 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 EGLN3Q9H6Z9 239 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 POLE4Q9NR33 117 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CBLN4Q9NTU7 201 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ARMC1Q9NVT9 282 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 VNN3Q9NY84 501 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 IL20Q9NYY1 176 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 LAMP3Q9UQV4 416 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa4.7□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 A0A1W2PPR1 153 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 BHLHE40O14503 412 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 SGCEO43556 437 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 DOK2O60496 412 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 MT-ND5P03915 603 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 HMGN1P05114 100 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 CELA3BP08861 270 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 OR4A8P0C604 315 aa4.69□□□□□ -1.66
HMGB1P40-201ENST00000525121 PATE4P0C8F1 98 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms