RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517982.1

PTDSS1-204, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTDSS1, Length 1,215 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-204ENST00000517982 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 POLR1DQ9Y2S0 133 aa11.66□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.66□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.66□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 J3QKU1 62 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 ZNF813Q6ZN06 617 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 DPPA2Q7Z7J5 298 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 GABRG1Q8N1C3 465 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 CNIH3Q8TBE1 160 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PTDSS1-204ENST00000517982 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 KCNG2Q9UJ96 466 aa11.65□□□□□ -0.54
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PTDSS1-204ENST00000517982 WNT11O96014 354 aa11.63□□□□□ -0.55
PTDSS1-204ENST00000517982 ITGA5P08648 1049 aa11.63□□□□□ -0.55
PTDSS1-204ENST00000517982 B4GALT1P15291 398 aa11.63□□□□□ -0.55
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PTDSS1-204ENST00000517982 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
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