RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514141.5

POLK-215, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene POLK, Length 4,345 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-215ENST00000514141 SHBQ15464 509 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PLXDC2Q6UX71 529 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF573Q86YE8 665 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GHDCQ8N2G8 530 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 C17orf78Q8N4C9 275 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DTX3Q8N9I9 347 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OTOSQ8NHW6 89 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 CAPSLQ8WWF8 208 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RLN3Q8WXF3 142 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FUZQ9BT04 418 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF226Q9NYT6 803 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PLXNA2O75051 1894 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 STK17BO94768 372 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 IFNA1P01562 189 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DLSTP36957 453 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RAD52P43351 418 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LSSP48449 732 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MLF1P58340 268 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PERM1Q5SV97 790 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NHLRC1Q6VVB1 395 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF627Q7L945 461 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GPR155Q7Z3F1 870 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 C1orf87Q8N0U7 546 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FAM71CQ8NEG0 241 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GPR119Q8TDV5 335 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RASD2Q96D21 266 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TXNDC15Q96J42 360 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SLC6A7Q99884 636 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 CACNG6Q9BXT2 260 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LINC00470Q9BZP3 86 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FOXQ1Q9C009 403 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ABCG5Q9H222 651 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PIGMQ9H3S5 423 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LHX9Q9NQ69 397 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ACOXLQ9NUZ1 547 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PLEK2Q9NYT0 353 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF222Q9UK12 451 aa5.3□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 C11orf98E9PRG8 122 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FRS3O43559 492 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TSPAN2O60636 221 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 IL7P13232 177 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 AMY2BP19961 511 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GNMTQ14749 295 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GRK1Q15835 563 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OLFML2AQ68BL7 652 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PIGTQ969N2 578 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PMEPA1Q969W9 287 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TMEM45BQ96B21 275 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 EGLN1Q9GZT9 426 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ADAM19Q9H013 955 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OR51E2Q9H255 320 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RHBDL2Q9NX52 303 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 B9D1Q9UPM9 204 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MAB21L2Q9Y586 359 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NPIPA7E9PJI5 369 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TRAPPC2LH3BP13 241 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 M0R233 179 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PRRG2O14669 202 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LCATP04180 440 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NPIPA8P0DM63 369 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 LIPCP11150 499 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 PMELP40967 661 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DHODHQ02127 395 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 RPL18Q07020 188 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 FAPQ12884 760 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SKP2Q13309 424 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MPPED2Q15777 294 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 C6orf183Q5T699 404 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 ZNF615Q8N8J6 731 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SDR9C7Q8NEX9 313 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 OR2M7Q8NG81 312 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 GPR32P1Q8NGA4 272 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 MIB2Q96AX9 1013 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.29□□□□□ -1.56
POLK-215ENST00000514141 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms