RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 SCG5P05408 212 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CD14P08571 375 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NR4A1P22736 598 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MS4A2Q01362 244 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ANKDD1AQ495B1 522 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OTPQ5XKR4 325 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM205BPQ63HN1 556 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RRM2BQ7LG56 351 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR3BQ9P1U1 418 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FZR1Q9UM11 496 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCA1O95477 2261 aa16.13■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PPL8 197 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM129A0AVI4 362 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 UNC119BA6NIH7 251 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PTP4A3O75365 173 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SERPINA5P05154 406 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF32P17041 273 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ITGA2P17301 1181 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NPR2P20594 1047 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MNAT1P51948 309 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ERVS71-1P61550 626 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CHRNB3Q05901 458 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RAB35Q15286 201 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC36A2Q495M3 483 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATS1Q496A3 300 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NRN1LQ496H8 165 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LCN8Q6JVE9 175 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ZER1Q7Z7L7 766 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC30A7Q8NEW0 376 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FANK1Q8TC84 345 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MCUR1Q96AQ8 359 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF121Q9H920 327 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1RAPQ9NPH3 570 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 VNN3Q9NY84 501 aa16.12■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 A6NIZ1 184 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 B9A039 149 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SOCS2O14508 198 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 UBOX5O94941 541 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NDUFB2O95178 105 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM157BP0CG42 384 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CTLA4P16410 223 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LAP3P28838 519 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RAP1BP61224 184 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 RAP1AP62834 184 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SGCAQ16586 387 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LRP11Q86VZ4 500 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 AKR7LQ8NHP1 331 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT3Q9BQG1 590 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 REG4Q9BYZ8 158 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SIAEQ9HAT2 523 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 EMC7Q9NPA0 242 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NRIP3Q9NQ35 241 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 GRHPRQ9UBQ7 328 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 AURKCQ9UQB9 309 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TANC2Q9HCD6 1990 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.11■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC22A23A1A5C7 686 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10H3O60404 316 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R3DO95685 299 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MAGEA2P43356 314 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PPOXP50336 477 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 EFNA4P52798 201 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 THEM4Q5T1C6 240 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 UGT2A3Q6UWM9 527 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 IL17RDQ8NFM7 739 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR10H5Q8NGA6 315 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 DOK1Q99704 481 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 BTBD10Q9BSF8 475 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SYT4Q9H2B2 425 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 TPK1Q9H3S4 243 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC7A8Q9UHI5 535 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.1■□□□□ 0.17
SH3BP2-218ENST00000511185 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms