RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SGCBQ16585 318 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 C2orf76Q3KRA6 126 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 LCN10Q6JVE6 187 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TDHQ8IZJ6 230 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 DUSP18Q8NEJ0 188 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CST11Q9H112 138 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RARRES3Q9UL19 164 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1W2PNR3 127 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TMEM82A0PJX8 343 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RAF1P04049 648 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CAPZBP47756 277 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF74Q16587 644 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TSSK4Q6SA08 328 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 UEVLDQ8IX04 471 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC41A2Q96JW4 573 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP25Q9NPA2 562 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ACKR4Q9NPB9 350 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD10Q9NXR5 420 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 STEAP1Q9UHE8 339 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PILRAQ9UKJ1 303 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PHYHO14832 338 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 AMY2BP19961 511 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.558e-8■■■■■ 30.2
RABGEF1-211ENST00000503687 PPICP45877 212 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 P2RX1P51575 399 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 FMODQ06828 376 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SMCO1Q147U7 214 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NPSR1Q6W5P4 371 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 LRRC18Q8N456 261 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NUDT9Q9BW91 350 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 OR5V1Q9UGF6 321 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SPTA1P02549 2419 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RAP2BP61225 183 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CCINQ13939 588 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC35D3Q5M8T2 416 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 LIX1LQ8IVB5 337 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 OR11H7Q8NGC8 314 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ZBTB8AQ96BR9 441 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 OR6C1Q96RD1 312 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 DCTN6O00399 190 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 AGPAT2O15120 278 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC9A3R2Q15599 337 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SWI5Q1ZZU3 235 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZTK2 550 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NPEPL1Q8NDH3 523 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 BANF2Q9H503 90 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SLC39A1Q9NY26 324 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CTSFQ9UBX1 484 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0B4J293 547 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CT45A8P0DMV1 189 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CT45A9P0DMV2 189 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 MMP15P51511 669 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 TNK1Q13470 666 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 CT45A2Q5DJT8 189 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NR2C2APQ86WQ0 139 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 VSTM2LQ96N03 204 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 DCBLD2Q96PD2 775 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 B9D1Q9UPM9 204 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SULT2B1O00204 365 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ANKRD34CP0C6C1 535 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 GLI4P10075 376 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PI3P19957 117 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 C19orf48Q6RUI8 117 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NLRC3Q7RTR2 1065 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 STEAP2Q8NFT2 490 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 GABRG3Q99928 467 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 GSX2Q9BZM3 304 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 PLXNA3P51805 1871 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 LGALS8O00214 317 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 ADAM11O75078 769 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 RLN2P04090 185 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 SELENOPP49908 381 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGEF1-211ENST00000503687 AKR1C2P52895 323 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms