RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498678.5

HOXB3-212, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 2,196 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-212ENST00000498678 MPZL1O95297 269 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXB3-212ENST00000498678 HPNP05981 417 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 RAC3P60763 192 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 NHLH1Q02575 133 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 MEP1BQ16820 701 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 CCDC58Q4VC31 144 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 C6orf183Q5T699 404 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXB3-212ENST00000498678 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXB3-212ENST00000498678 CENPSQ8N2Z9 138 aa23.21■■□□□ 1.31
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HOXB3-212ENST00000498678 MED18Q9BUE0 208 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 BARHL1Q9BZE3 327 aa23.2■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 TACSTD2P09758 323 aa23.19■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CCL11P51671 97 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 CARD18P57730 90 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 POU4F3Q15319 338 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 UBQLNLQ8IYU4 475 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 ABHD4Q8TB40 342 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 FAM166BA8MTA8 275 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 UPK3AO75631 287 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 GLSO94925 669 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CLDN17P56750 224 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 SLC25A46Q96AG3 418 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 AKIP1Q9NQ31 210 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 ZNF726A6NNF4 738 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CD1AP06126 327 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 MAGEA5P43359 124 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 MEOX1P50221 254 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 RORCP51449 518 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 SLC17A1Q14916 467 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CARD17Q5XLA6 110 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 FAM220AQ7Z4H9 259 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 RPS4Y2Q8TD47 263 aa23.18■■□□□ 1.3
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HOXB3-212ENST00000498678 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP23.18■■□□□ 1.33e-6■■■□□ 15.8
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HOXB3-212ENST00000498678 SC5DO75845 299 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 HIST3H3Q16695 136 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 FAM209AQ5JX71 171 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 SLC18B1Q6NT16 456 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 MS4A15Q8N5U1 240 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 FDCSPQ8NFU4 85 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 OR2V1Q8NHB1 315 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXB3-212ENST00000498678 KCNN2Q9H2S1 579 aa23.17■■□□□ 1.3
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