RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495949.1

RALGAPB-208, Transcript of Ral GTPase activating protein non-catalytic beta subunit, humanhuman

TSL 3

Gene RALGAPB, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPB-208ENST00000495949 LYPD3O95274 346 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CH25HO95992 272 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 THY1P04216 161 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 HMGN1P05114 100 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 HPNP05981 417 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SFTPCP11686 197 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FUT1P19526 365 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CHMP24386 653 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 DUSP1P28562 367 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SLC6A6P31641 620 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 RPL4P36578 427 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 GSSP48637 474 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PPIAP62937 165 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FOXF1Q12946 379 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 INAQ16352 499 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 HYAL4Q2M3T9 481 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SLC36A3Q495N2 470 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SYT14P1Q58G82 188 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 C6orf52Q5T4I8 152 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 C1orf140Q5VVS0 124 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SMARCD3Q6STE5 483 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 WDR88Q6ZMY6 472 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CHMP1BQ7LBR1 199 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 UEVLDQ8IX04 471 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 OR2T33Q8NG76 320 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PFN4Q8NHR9 129 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FANK1Q8TC84 345 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 LIPHQ8WWY8 451 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SLC25A36Q96CQ1 311 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 NTNG2Q96CW9 530 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CNBD2Q96M20 576 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 Q96MT0 163 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SFXN2Q96NB2 322 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ZNF570Q96NI8 536 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 OR2B2Q9GZK3 357 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ADNPQ9H2P0 1102 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 EXO5Q9H790 373 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FKRPQ9H9S5 495 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 IL20Q9NYY1 176 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 TRAPPC4Q9Y296 219 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CDH10Q9Y6N8 788 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CFAP54Q96N23 3096 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 OR2M5A3KFT3 312 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SULT2B1O00204 365 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 TFECO14948 347 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SEC14L5O43304 696 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 DNPH1O43598 174 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 IDH3BO43837 385 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PIP5K1CO60331 668 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ZIC3O60481 467 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MITFO75030 526 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 NDUFB8O95169 186 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 NDUFB2O95178 105 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SOX14O95416 240 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PMS2P2O95744 297 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ACTL6AO96019 429 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 IFNGP01579 166 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PEPDP12955 493 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ZNF24P17028 368 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PAICSP22234 425 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MYF6P23409 242 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 MST1P26927 711 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 CSNK2BP67870 215 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SLC35A1P78382 337 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 IL5RAQ01344 420 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 EGR4Q05215 589 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 FOXO1Q12778 655 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 PMS2P3Q13401 168 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 GALEQ14376 348 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 GINS1Q14691 196 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ZNF74Q16587 644 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 GFOD2Q3B7J2 385 aa5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
RALGAPB-208ENST00000495949 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms