RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 RAP2CQ9Y3L5 183 aa11.96□□□□□ -0.49
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PRPF40A-211ENST00000493468 SEPHS2Q99611 448 aa11.93□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 TMEM27Q9HBJ8 222 aa11.93□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 LOC100509620A0A075B734 347 aa11.92□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 TLDC2A0PJX2 215 aa11.92□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 C5orf63A6NC05 138 aa11.92□□□□□ -0.5
PRPF40A-211ENST00000493468 PIN1P1O15428 100 aa11.92□□□□□ -0.5
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