RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493107.5

SEC22C-216, Transcript of SEC22 homolog C, vesicle trafficking protein, humanhuman

TSL 5

Gene SEC22C, Length 827 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22C-216ENST00000493107 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 AQP6Q13520 282 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TPBGQ13641 420 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 MED22Q15528 200 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 KCNMB1Q16558 191 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CTF1Q16619 201 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TEX30Q5JUR7 227 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 GPR107Q5VW38 600 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 RTL6Q6ICC9 239 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 SEM1Q6ZVN7 128 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 NSMAFQ92636 917 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 HTRA1Q92743 480 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 NABP1Q96AH0 204 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 RBP7Q96R05 134 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 YIPF3Q9GZM5 350 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 NDUFA13Q9P0J0 144 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 KLHL9Q9P2J3 617 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ENPP5Q9UJA9 477 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CAMK2AQ9UQM7 478 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF175Q9Y473 711 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 URB1O60287 2271 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 USP24Q9UPU5 2620 aa8.32□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ATMQ13315 3056 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 DAPL1A0PJW8 107 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 MYL12BO14950 172 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 GABARAPO95166 117 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ATE1O95260 518 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 HRGP04196 525 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CD36P16671 472 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CPEP16870 476 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 NR4A1P22736 598 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 LAP3P28838 519 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CDAP32320 146 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TTKP33981 857 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ATP6V1E1P36543 226 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CRYBB2P43320 205 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CSNK1A1P48729 337 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CENPAP49450 140 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CLRN1P58418 232 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CNPY1Q3B7I2 92 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TSPO2Q5TGU0 170 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PCSK4Q6UW60 755 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 AAED1Q7RTV5 226 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 KLBQ86Z14 1044 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PHC2Q8IXK0 858 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 KLHL36Q8N4N3 616 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 OR10S1Q8NGN2 331 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 OTOSQ8NHW6 89 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ST7LQ8TDW4 575 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ISOC1Q96CN7 298 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PELI1Q96FA3 418 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 C4orf36Q96KX1 117 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 INTS14Q96SY0 518 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TTTY10Q9BZA0 68 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 RERGLQ9H628 205 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 EXO5Q9H790 373 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 POLE4Q9NR33 117 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 BABAM2Q9NXR7 383 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CLEC4AQ9UMR7 237 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 FAM208BQ5VWN6 2430 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 OR14I1A6ND48 311 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 H3BMQ9 156 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PSMD9O00233 223 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 OGG1O15527 345 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 DHHO43323 396 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 GPX5O75715 221 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 SYNGR4O95473 234 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 YES1P07947 543 aa8.3□□□□□ -1.08
SEC22C-216ENST00000493107 PCSK6P29122 969 aa8.3□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms