RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	CCNB2	O95067	398 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NTN1	O95631	604 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ANGPTL1	O95841	491 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ATP1B1	P05026	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	GUSB	P08236	651 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ALPPL2	P10696	532 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	CDK4	P11802	303 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	IRF2	P14316	349 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	CPM	P14384	443 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MNDA	P41218	407 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	THBS3	P49746	956 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	XK	P51811	444 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RAB38	P57729	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SMIM11A	P58511	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	PPP1CA	P62136	330 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ESRRG	P62508	458 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	IL5RA	Q01344	420 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ILK	Q13418	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	C1orf61	Q13536	156 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ELOC	Q15369	112 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	LTB4R	Q15722	352 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ARHGAP11B	Q3KRB8	267 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM166A	Q6J272	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM107	Q6UX40	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ERI1	Q8IV48	349 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ARL14	Q8N4G2	192 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	LINC00471	Q8N535	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	OR7G2	Q8NG99	324 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	C16orf58	Q96GQ5	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MAGED4	Q96JG8	741 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	PRRC1	Q96M27	445 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	COL21A1	Q96P44	957 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ARHGDIG	Q99819	225 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	LAT2	Q9GZY6	243 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM60A	Q9NP50	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	EPHA6	Q9UF33	1036 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SATB2	Q9UPW6	733 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	RNF6	Q9Y252	685 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TPRKB	Q9Y3C4	175 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FAM32A	Q9Y421	112 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNE3	Q9Y6H6	103 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SPACA6	W5XKT8	324 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.73	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PN81	502 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	SH3PXD2B	A1X283	911 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	LMO7DN	F2Z398	122 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FAAH	O00519	579 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	AQP9	O43315	295 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	FGF17	O60258	216 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	GPR75	O95800	540 aa		4.72	□□□□□ -1.65
ZNF638-223	ENST00000492262	ALPP	P05187	535 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms